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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000066`

染色体: Chr07 坐标: 305730-308737 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000066`
名称	SmilChr07G000066
描述	deacetoxyvindoline 4-hydroxylase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	305730 - 308737 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991255`
GeneID	`130991255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991255`
原始查询	`SmilChr07G000066`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	deacetoxyvindoline 4-hydroxylase-like
产物	deacetoxyvindoline 4-hydroxylase-like
Arabidopsis	`AT5G59530` (AT5G59530) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836072] identity=49.2; qcov=0.965; evalue=2.5e-118; confidence=high
Rice	`Os03g0690500` - identity=45.6; qcov=0.976; evalue=1.39e-103; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771348.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771348.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771348.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771348.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:306046`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	72	A10,A13,A15,A19,A20,A23,A24,A6,A9,B1,B10,B106,B108,B11,B111,B120,B129,B131,B137,B14,B18,B22,B28,B38,B39,B40,B5,B53,B55,B59,B6,B75,B77,B79,B87,B89,B9,C11,C16,C17,C19,C20,C21,C23,C25,C28,C29,C3,C34,C35,C36,C40,C43,C46,C47,C48,C51,C53,C54,C55,C59,C6,C60,C61,C63,C67,C69,C80,C86,C9,D4,D5
`Chr7:306050`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	71	A10,A13,A15,A19,A20,A23,A24,A6,A9,B1,B10,B106,B108,B11,B111,B120,B129,B131,B137,B14,B18,B22,B28,B38,B40,B5,B53,B55,B59,B6,B75,B77,B79,B87,B89,B9,C11,C16,C17,C19,C20,C21,C23,C25,C28,C29,C3,C34,C35,C36,C40,C43,C46,C47,C48,C51,C53,C54,C55,C59,C6,C60,C61,C63,C67,C69,C80,C86,C9,D4,D5
`Chr7:306565`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B44
`Chr7:306565`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B44
`Chr7:306628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B14,B79
`Chr7:306647`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	105	A10,A13,A15,A18,A19,A22,A23,A24,A25,A4,A6,A8,A9,B10,B101,B103,B106,B108,B109,B11,B111,B113,B117,B118,B12,B124,B129,B138,B14,B16,B21,B25,B26,B27,B30,B36,B37,B38,B40,B41,B42,B43,B48,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B60,B65,B70,B75,B77,B78,B79,B8,B84,B86,B87,B89,B9,B91,B93,B94,B96,C11,C12,C16,C17,C19,C23,C24,C25,C28,C29,C3,C31,C35,C36,C39,C40,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C59,C60,C63,C69,C70,C73,C75,C8,C80,C81,C9,D11,D2,D4,D6
`Chr7:306648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B88,C16,C63
`Chr7:306649`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	105	A10,A13,A15,A18,A19,A22,A23,A24,A25,A4,A6,A8,A9,B10,B101,B103,B106,B108,B109,B11,B111,B113,B117,B118,B12,B124,B129,B138,B14,B16,B21,B25,B26,B27,B30,B36,B37,B38,B40,B41,B42,B43,B48,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B60,B65,B70,B75,B77,B78,B79,B8,B84,B86,B87,B89,B9,B91,B93,B94,B96,C11,C12,C16,C17,C19,C23,C24,C25,C28,C29,C3,C31,C35,C36,C39,C40,C45,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C59,C60,C63,C69,C70,C73,C75,C8,C80,C81,C9,D11,D2,D4,D6
`Chr7:306711`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	118	A11,A14,A16,A2,A21,A23,A5,B10,B104,B106,B110,B111,B112,B114,B115,B120,B121,B125,B126,B13,B131,B132,B134,B136,B140,B15,B17,B2,B20,B23,B26,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B38,B4,B41,B44,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B56,B57,B59,B6,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B70,B73,B76,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B85,B89,B90,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C20,C21,C22,C26,C27,C32,C34,C39,C4,C43,C47,C51,C56,C57,C58,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C78,C8,C83,C85,C86,D1,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr7:308487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B88,C16,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771348.1

373 aa

186

373

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 55-153 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 212-303 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771348.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	55	153	1.8e-18	68.0	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057771348.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	212	303	5.3e-30	104.4	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915365.1
AGCATAATTTCTTTTTATAATAGTAAAAACTTTAATTAATCTAATAAACAATTAATTACTTGGCCGGTGGCGTGACGCGTGCAAGTTCATTAATTTTTCCTTCTCGGCGTTCTCGCACCGAGTCTTCCACCCTCCCCAGACGTATATATCTTTAAATAAAACTACAATCATCTAAATATTTTAACAATTTTCTGCTCAACAATTCTGAAAATCCCCAAAATTAAGAAATGCAGGAAGACGATCGCGTGAAGGAGCTCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991255
ATGCAGGAAGACGATCGCGTGAAGGAGCTCCAGGCTTTCGAGGCCACAAAAGCCGGCGTGAAAGGGCTAATCGACGCCGGCATCCAGAAGGTTCCGAGAATGTTCATCAGGCCAGCCGATGAGCTCGTGGAGGAGCTCAACTGCGCGCGCTCGGCTCTGCAAGTTCCGGTGATAGACCTCGGCCGGATCGGAGAAGGCGATCATCGCGAGAAGGTTGTCGGCGAGGTGAGGAGGGCGTCGAAGGAGCTCGGGATCTTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771348.1
MQEDDRVKELQAFEATKAGVKGLIDAGIQKVPRMFIRPADELVEELNCARSALQVPVIDLGRIGEGDHREKVVGEVRRASKELGIFQIVNHGVAVEVMDAMLDGVRKFHELDAEVKKQFHSRESMQKVKYASNVDLYRSRAANWRDSLTISLMGSDRLPPEELPEICRDSTIKYLDEVTSLGETLFELLSEALGLKRGYLGALKCGQGRTFIGHYYPPCPEPELTMGTATHTDPSFLTILLQDQIGGLQALHNNQYINVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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