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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000070`

染色体: Chr07 坐标: 327790-330646 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000070`
名称	SmilChr07G000070
描述	probable methyltransferase TCM_000336
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	327790 - 330646 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991262`
GeneID	`130991262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991262`
原始查询	`SmilChr07G000070`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable methyltransferase TCM_000336
产物	probable methyltransferase TCM_000336
Arabidopsis	`AT4G36470` (AT4G36470) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829799] identity=51.1; qcov=0.879; evalue=8.35e-61; confidence=high
Rice	`Os01g0701700` - identity=44.5; qcov=0.923; evalue=2.19e-49; confidence=medium
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771353.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771353.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057771353.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771353.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771353.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:328828`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A11,C17
`Chr7:328828`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A11,C17
`Chr7:328902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr7:328948`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	B1,B114,B128,B23,C11,C15,C23,C30,C33,C56,C69,C9,D5,D9
`Chr7:328968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B38,B39,D4
`Chr7:329042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:329074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr7:329118`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	A24,A7,B22,C62,C85
`Chr7:329118`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	CDS_variant	5	A24,A7,B22,C62,C85
`Chr7:329343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr7:329378`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	125	A10,A11,A18,A21,A22,A23,A24,A3,A7,B1,B100,B104,B106,B107,B114,B115,B117,B12,B121,B122,B123,B124,B128,B131,B132,B136,B137,B139,B14,B15,B2,B22,B23,B26,B27,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B45,B47,B50,B52,B54,B56,B58,B59,B6,B60,B62,B63,B65,B67,B68,B69,B71,B74,B76,B78,B79,B8,B81,B83,B88,B90,B96,B97,B98,B99,C11,C12,C17,C2,C23,C25,C27,C29,C30,C33,C36,C37,C38,C39,C41,C43,C45,C46,C48,C49,C50,C51,C52,C54,C55,C56,C58,C59,C61,C62,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C74,C77,C78,C79,C8,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D5,D7,D9
`Chr7:329392`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	44	A11,A18,A22,A23,A3,B1,B104,B12,B124,B128,B133,B27,B3,B30,B32,B34,B47,B52,B58,B62,B63,B71,B78,B8,B82,B88,B97,C12,C17,C25,C38,C41,C43,C45,C48,C49,C50,C53,C6,C61,C8,C84,D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771353.1

207 aa

104

207

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 19-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771353.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	19	191	7.4e-62	210.1	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915370.1
ATTTTCTTGTAAATAAATTATGTTAATTAGATACTTAATCCAAATATTACTAATTATAGTATAGACATTTAATTAATAATCTTATATTTTCAAGATAAATAACTTAACGAGCTTGCCCACGAGCTAACGAGTAGAGTATCGTCGTGCTCAAAAGCTTGACTCGTTTAGCTAAACGAGCTGCTCATTAAAATTACCGATCGAGCTTTTATCGAGTTGAACGTCGAATAGTTCACAAGTAGCTTGATTCGTCTACTGCCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991262
ATGTATAGTTTTCAGTCATGTCTTGTCGAGAAGCCCTTCATCGCCATGGACGTGGAGAAAGTGTTTCACATGAATGGAGGAATTGGAGAAACAAGCTATCACGAGAACTCTTCTCTTCAGAAAAATGCTGCTGAAAGGATTCAAGACATAGCCTTGGAAGCCATGGAAGAAACGTATTCGGCGTTGAGGCCGCGAAGCCTCGGCATAGCCGATCTCGGCTGCTCATCGGGCTCCAACGCCCTGCGTTACGTCAAGATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771353.1
MYSFQSCLVEKPFIAMDVEKVFHMNGGIGETSYHENSSLQKNAAERIQDIALEAMEETYSALRPRSLGIADLGCSSGSNALRYVKMAVAAVISRDAAPLPEFRVCLNDLPSNDFNTVFAALPDFFQELKKGRKDPSVLVAAYPGSFYGRLFPRNSLHLLFSFSSLHWLSRIPPGIYDERGVSMNKKSITLVREYWMNYLMNMPNYWK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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