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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000073`

染色体: Chr07 坐标: 338427-346969 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000073`
名称	SmilChr07G000073
描述	actin-related protein 9
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	338427 - 346969 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991266`
GeneID	`130991266`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991266`
原始查询	`SmilChr07G000073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-related protein 9
产物	actin-related protein 9
Arabidopsis	`AT5G43500` (ARP9) actin-related protein 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834370] identity=58.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0177600` (ARP9) - identity=59; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006302 (double-strand break repair); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0031011 (Ino80 complex)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00022 (Actin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991266

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771356.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771356.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771356.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771356.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771356.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:338728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr7:338888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:339132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C20
`Chr7:340404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B71
`Chr7:340878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr7:340903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:342313`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A2,B118,B130,B36,B44,B6,B93,C54,C64,C66,C67,C86,D11
`Chr7:342315`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	A2,B118,B130,B36,B44,B6,B93,C54,C64,C66,C67,C86,D11
`Chr7:344810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B31,B52
`Chr7:345036`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B57
`Chr7:345589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:345618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771356.1

595 aa

298

595

Actin

PF00022 Actin 215-570 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771356.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	215	570	5.3e-24	85.3	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915373.1
AGAGGAGAAAATCATATTCGTGTTTGAAGACAACATGATTTACAGGCCAAAAAGCACGACGAAAATACTTCAAAGTTGAAAGAACAAAACCATCTCTACGCGAAAAACAAAACCATCTCTTTGTTAAATACTCTCAACAGCTGCTCTAAGCTTTTCCAACTGCGTCTGCTATGGATTACCTTAAAACAGTAGTCCCCTCTCAACTCCTCGCTGAGCGCGGCTCCAACCTCGTCGTCATCAACCCAGGGTCCGCGAATGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991266
ATGGATTACCTTAAAACAGTAGTCCCCTCTCAACTCCTCGCTGAGCGCGGCTCCAACCTCGTCGTCATCAACCCAGGGTCCGCGAATGTAAGAATAGGGCTAGCGCAGCAGGATGCCCCGATTAGTGTTCCGCATTGCATTGCGCGACGCACATCTCAAGTGCCTAAAAGGAATGTTCAGGATCAGTTGCTTAATTCTCAGGTGACAACAGCGCAGCACATGGAGCGAGAAAGGGCTTACGACATTATTGCTTCGCTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771356.1
MDYLKTVVPSQLLAERGSNLVVINPGSANVRIGLAQQDAPISVPHCIARRTSQVPKRNVQDQLLNSQVTTAQHMERERAYDIIASLLKIRFLDEEVTNNQFSQKMGRVDGFPPQNNNKKETIIPWTDVLEKQTPSSSSSSSSSSEHGSSLRSEDPSTEKESNVNEEPSSTGHKYRECIYGEEALRISATEPYCLRRPIRRGHLNISLYYPMQQVIEDIHAIWEWALIEKLHIPRSERHMYSAVLVLPETFDNREIKELLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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