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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000076`

染色体: Chr07 坐标: 354747-358566 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000076`
名称	SmilChr07G000076
描述	uncharacterized SmilChr07G000076
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	354747 - 358566 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991268`
GeneID	`130991268`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991268`
原始查询	`SmilChr07G000076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HNH endonuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816916]; symbol=AT2G23840; hit=AT2G23840; species=arabidopsis; confidence=high
产物	HNH endonuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816916]; symbol=AT2G23840; hit=AT2G23840; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G23840` (AT2G23840) HNH endonuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816916] identity=50.9; qcov=1.15; evalue=5.79e-88; confidence=high
Rice	`Os07g0170200` - identity=62.4; qcov=0.663; evalue=7.26e-70; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01844 (HNH); PF14279 (HNH_5); PF30803 (HNH_assoc_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991268

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771358.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057771358.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771358.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771358.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771358.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:355062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:358161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:358184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr7:358233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr7:358240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C74,D3
`Chr7:358245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C6,C62
`Chr7:358317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771358.1

274 aa

137

274

HNH_assoc_N

HNH

HNH_5

PF30803 HNH_assoc_N 98-152 aa PF01844 HNH 178-219 aa PF14279 HNH_5 178-229 aa

XP_057771359.1

249 aa

124

249

HNH_assoc_N

HNH

HNH_5

PF30803 HNH_assoc_N 98-124 aa PF01844 HNH 153-194 aa PF14279 HNH_5 153-204 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771358.1`	Pfam	`PF30803`	HNH_assoc_N	Domain	98	152	1.9e-18	66.7	HNH endonuclease-associated, N-terminal domain
`XP_057771358.1`	Pfam	`PF01844`	HNH	Family	178	219	6e-13	49.4	HNH endonuclease
`XP_057771358.1`	Pfam	`PF14279`	HNH_5	Domain	178	229	4.5e-17	62.5	HNH endonuclease
`XP_057771359.1`	Pfam	`PF30803`	HNH_assoc_N	Domain	98	124	2.4e-07	31.2	HNH endonuclease-associated, N-terminal domain
`XP_057771359.1`	Pfam	`PF01844`	HNH	Family	153	194	5.1e-13	49.7	HNH endonuclease
`XP_057771359.1`	Pfam	`PF14279`	HNH_5	Domain	153	204	3.8e-17	62.7	HNH endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915375.1
ATTTAGGAAGCGGAGGCCCGAAATGAAAATATGTGGCAGCGAGAGATTTTACGTGATCAAATTTAGTATAGTTGGAAAACAAGCAAACCAAAAACAAAGGATATTCCTTTTTCTTATTCAATTCCAATTTGAACAATCTTGGATCCCGCTTTCGAAAAATCCACCAATTATTGCATTTGCAAGTGATGCAATTAGTTAAGTGTGCGTGATTGCGTTAAGATTCTGCGGTGAATTGATGGCGCAATTTACCGCCGGCGTCC...

XM_057915376.1
GCGGAGGCCCGAAATGAAAATATGTGGCAGCGAGAGATTTTACGTGATCAAATTTAGTATAGTTGGAAAACAAGCAAACCAAAAACAAAGGATATTCCTTTTTCTTATTCAATTCCAATTTGAACAATCTTGGATCCCGCTTTCGAAAAATCCACCAATTATTGCATTTGCAAGTGATGCAATTAGTTAAGTGTGCGTGATTGCGTTAAGATTCTGCGGTGAATTGATGGCGCAATTTACCGCCGGCGTCCGTCTAAAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991268
ATGGCGCAATTTACCGCCGGCGTCCGTCTAAAGCCTCTCGTAACTGGAAACGGCATGTCGGTAGGGTTCGGCGCATTTCACCGCCGCTGTAGAGTTAAGTGTTTCGGCGGCGGAGGTTTCAGCTGCTCGCGTTCGGGAGATCGCAAGCGCAAGCTCTGCGATTCTACGGCGCACGCCTCCAAATCGTCGCCGCCGCCGTCGTCTGCGACGAGCAATGCTGGTGGAGTGTTTGATGAAGTGTTGGAGGATGAAGCAGGGTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771358.1
MAQFTAGVRLKPLVTGNGMSVGFGAFHRRCRVKCFGGGGFSCSRSGDRKRKLCDSTAHASKSSPPPSSATSNAGGVFDEVLEDEAGFEIDELSGFRGLVLDISYRPVNVVCWKRAICLEFMDKADVLEYYDQTINSPSGSFYIPAVLRVPHLLQIVKRRKVKRGLSRKNIFQRDNYTCQYCSSTENLTIDHVFPIARGGKWTWENLVAACSRCNCKKGQKTLEEASMKLLKVPKAPKDYELLAIPLTHYAIKMMKRKGLP...

XP_057771359.1
MAQFTAGVRLKPLVTGNGMSVGFGAFHRRCRVKCFGGGGFSCSRSGDRKRKLCDSTAHASKSSPPPSSATSNAGGVFDEVLEDEAGFEIDELSGFRGLVLDISYRPVNVVCWKRAICLEFMDKVPHLLQIVKRRKVKRGLSRKNIFQRDNYTCQYCSSTENLTIDHVFPIARGGKWTWENLVAACSRCNCKKGQKTLEEASMKLLKVPKAPKDYELLAIPLTHYAIKMMKRKGLPEEWKQYLSKPYAAP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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