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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000078`

染色体: Chr07 坐标: 364181-421437 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000078`
名称	SmilChr07G000078
描述	uncharacterized SmilChr07G000078
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	364181 - 421437 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991275`
GeneID	`130991275`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991275`
原始查询	`SmilChr07G000078`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838517]; symbol=AT1G03220; hit=AT1G03220; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838517]; symbol=AT1G03220; hit=AT1G03220; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G03220` (AT1G03220) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838517] identity=50.8; qcov=0.293; evalue=1.37e-13; confidence=weak
Rice	`Os05g0403000` - identity=49.2; qcov=0.293; evalue=1.54e-10; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14541 (TAXi_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991275

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057771365.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771365.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057771365.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771365.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771365.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:364769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B60,B71,B81,B87
`Chr7:364798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr7:364821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B62
`Chr7:364871`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr7:364871`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96
`Chr7:364875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B20,C63
`Chr7:364910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C52,C61
`Chr7:364911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B38,C13,D2
`Chr7:364912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C11,C69
`Chr7:364919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B68,C74
`Chr7:364921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B3,B89
`Chr7:364930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C40,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771365.1

229 aa

114

229

TAXi_C

PF14541 TAXi_C 144-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771365.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	144	219	4.8e-17	62.9	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915382.1
CTCTCTCGAAATTGACCATGCCGCCACCCTCTTTCCAGCGAGAATCGTCGGCAGCCGCGCCCCCCTCACGACCCCTCCACTCTGAAAACGCAGCCGCCTCTTCCCCTCAAAATTTCCGGCGAGATCCACTGGAAACATCGCCTCCTTCCCCTATATCTCTTCGGAACGACAGCCGCGACTCAGCCGGAACGCCGCCATCGCCACCTCCCTCGCCACAGTCGGATTCGCGAGGATGGCCTACCCGATTCGTGAATCCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991275
ATGCCGCCACCCTCTTTCCAGCGAGAATCGTCGGCAGCCGCGCCCCCCTCACGACCCCTCCACTCTGAAAACGCAGCCGCCTCTTCCCCTCAAAATTTCCGGCGAGATCCACTGGAAACATCGCCTCCTTCCCCTATATCTCTTCGGAACGACAGCCGCGACTCAGCCGGAACGCCGCCATCGCCACCTCCCTCGCCACAGTCGGATTCGCGAGGATGGCCTACCCGATTCGTGAATCCTTTTTTTTGGGGGGGGGGATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771365.1
MPPPSFQRESSAAAPPSRPLHSENAAASSPQNFRRDPLETSPPSPISLRNDSRDSAGTPPSPPPSPQSDSRGWPTRFVNPFFWGGGFARWRIPCESHANRTRTRSMYVSDTAMYSFSANPCIIEKILSVSVLSQSLSFSLYVCHLGIQSVAAVAPFRACFGSESIARTAAGPAVPEIELVLAGKGAATWRMRWSNVMVEIDRKTTCLGFVDGGSKTEGAAHAAAVLRHC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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