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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000083`

染色体: Chr07 坐标: 423604-429043 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000083`
名称	SmilChr07G000083
描述	cellulose synthase-like protein E6
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	423604 - 429043 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991278`
GeneID	`130991278`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991278`
原始查询	`SmilChr07G000083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cellulose synthase-like protein E6
产物	cellulose synthase-like protein E6
Arabidopsis	`AT4G24000` (CSLG2) cellulose synthase like G2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828500] identity=35.3; qcov=0.988; evalue=7.48e-157; confidence=medium
Rice	`Os09g0478100` (OsCslE1) - identity=34.6; qcov=1; evalue=1.14e-150; confidence=low
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009833 (plant-type primary cell wall biogenesis); GO:0016760 (cellulose synthase (UDP-forming) activity); GO:0030244 (cellulose biosynthetic process); GO:0051753 (mannan synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03552 (Cellulose_synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991278

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057771367.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057771367.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057771367.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771367.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771367.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:423732`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A11,A13,B101,B105,B109,B117,B12,B120,B14,B18,B21,B30,B34,B40,B47,B5,B50,B51,B53,B55,B71,B78,B84,C12,C23,C25,C36,C52,C77,C87
`Chr7:423736`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	30	A11,A13,B101,B105,B109,B117,B12,B120,B14,B18,B21,B30,B34,B40,B47,B5,B50,B51,B53,B55,B71,B78,B84,C12,C23,C25,C36,C52,C77,C87
`Chr7:423798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B18,D10
`Chr7:423807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B95,C58
`Chr7:423890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,C21,C76,C78
`Chr7:423967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:423978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C75,C76
`Chr7:423995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B127,B39
`Chr7:424002`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,C21,C76,C78
`Chr7:424010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,D4
`Chr7:424020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B127,B39
`Chr7:424022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B127,B39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771367.1

735 aa

368

735

Cellulose_synt

PF03552 Cellulose_synt 98-375 aa PF03552 Cellulose_synt 378-728 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771367.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	98	375	2.2e-130	437.2	Cellulose synthase
`XP_057771367.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	378	728	2.2e-130	437.2	Cellulose synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915384.1
TAAATAGAGCTAGAGCACCACTTATCTCTCACGAACAAAAAAAAATGGAGAAATCACTTCCTCTCAACGATTGGCAAGTGAAGAAAAGAAACAGAGCAATAAACAGACTCCATGGCTTCATCCATGGCGGCGCTTTAGCTGCCCTATTTTACTACAGAATCACAACCATCACCGCCATAGCCAAAAGCAGCAGCCCCATTCTTCCCCACCTTCTCATCTTCGCCGCCGAGCTCACTCTCTCATGCATGTGGCTGCTCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991278
ATGGAGAAATCACTTCCTCTCAACGATTGGCAAGTGAAGAAAAGAAACAGAGCAATAAACAGACTCCATGGCTTCATCCATGGCGGCGCTTTAGCTGCCCTATTTTACTACAGAATCACAACCATCACCGCCATAGCCAAAAGCAGCAGCCCCATTCTTCCCCACCTTCTCATCTTCGCCGCCGAGCTCACTCTCTCATGCATGTGGCTGCTCACCCAGGCTTCGCTGTGGAACCCGGTCGCGCGAAACGCCTACCCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771367.1
MEKSLPLNDWQVKKRNRAINRLHGFIHGGALAALFYYRITTITAIAKSSSPILPHLLIFAAELTLSCMWLLTQASLWNPVARNAYPERLPGDDNLPAIDVFVCTADPVKEPSLGVMNTVISAMALDYPPHKLHLYLSDDGGSPVTLRALRRARSFAKRWIPFCRKFGVKNRCPQAYFLREEIGGNGDHDFFVEKKAIEKAYDDFKISLDKIVAEADVGASRDHSPIVEVISDANSNGTDSSNDEEMPLVVYVAREKRPSH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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