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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000085`

染色体: Chr07 坐标: 440032-445357 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000085`
名称	SmilChr07G000085
描述	cellulose synthase-like protein G3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	440032 - 445357 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991281`
GeneID	`130991281`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991281`
原始查询	`SmilChr07G000085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cellulose synthase-like protein G3
产物	cellulose synthase-like protein G3
Arabidopsis	`AT4G23990` (CSLG3) cellulose synthase like G3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828499] identity=35.3; qcov=1.01; evalue=5.16e-151; confidence=medium
Rice	`Os09g0478100` (OsCslE1) - identity=34.2; qcov=0.982; evalue=1.85e-141; confidence=low
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009833 (plant-type primary cell wall biogenesis); GO:0016760 (cellulose synthase (UDP-forming) activity); GO:0030244 (cellulose biosynthetic process); GO:0051753 (mannan synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03552 (Cellulose_synt)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991281

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057771369.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057771369.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057771369.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771369.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771369.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:440230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C14
`Chr7:440271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B31,C45
`Chr7:440285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr7:440489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B58,B62,B88,C49,C61
`Chr7:440507`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A20
`Chr7:440507`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A20
`Chr7:440592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:441292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:441322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr7:441369`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B77
`Chr7:441369`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B77
`Chr7:441543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771369.1

724 aa

362

724

Cellulose_synt

PF03552 Cellulose_synt 109-384 aa PF03552 Cellulose_synt 396-722 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771369.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	109	384	9.2e-123	412.0	Cellulose synthase
`XP_057771369.1`	Pfam	`PF03552`	Cellulose_synt	Domain	396	722	9.2e-123	412.0	Cellulose synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915386.1
ATCCCTATATAAACACCAAAACACATTTTTATTAATATGCATTAATCAAATTTCCCTAATTAATTAAACAATATGGCATCAATTTCTCTCCACTCCTCCTACACCCTAGGAGCCACCGCGCCGGAGCCACCTCTCAACACATGCTCCGTGCAGCAGCCACGCGCCGCCCTCAGCCGCCTCCATGCGCTCCTCCACTCCGCGGCCGTCGCCGCCCTCCTCTACTACCGGCTCTCCAACCTCGCCCGCGGCGCCGTGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991281
ATGGCATCAATTTCTCTCCACTCCTCCTACACCCTAGGAGCCACCGCGCCGGAGCCACCTCTCAACACATGCTCCGTGCAGCAGCCACGCGCCGCCCTCAGCCGCCTCCATGCGCTCCTCCACTCCGCGGCCGTCGCCGCCCTCCTCTACTACCGGCTCTCCAACCTCGCCCGCGGCGCCGTGCCGCCTCTCCCGTGGGGCCTCGTCACCCTCGCCGAGCTCGTCCTCGCCTTCGTGTGGCTCCTCGCGCAGTCTTTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771369.1
MASISLHSSYTLGATAPEPPLNTCSVQQPRAALSRLHALLHSAAVAALLYYRLSNLARGAVPPLPWGLVTLAELVLAFVWLLAQSFRWRPVVRTAAPENLPGDEKLPGVDVFVCTADPKKEPVVEVMNTVLSAMAMDYPPEKLAVYLSDDGGAAATLYAMKEACRFAESWLPFCRKYGIKTRCPEAFFSSFGEDEREALAGDEFNAEADKIESKYDVFRRNVEKAAELEDSVNDDRPSHVEVIYDNKKNAGKDQSNKLPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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