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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000094`

染色体: Chr07 坐标: 513896-516133 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000094`
名称	SmilChr07G000094
描述	upstream activation factor subunit UAF30-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	513896 - 516133 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991290`
GeneID	`130991290`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991290`
原始查询	`SmilChr07G000094`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	upstream activation factor subunit UAF30-like
产物	upstream activation factor subunit UAF30-like
Arabidopsis	`AT4G26810` (AT4G26810) SWIB/MDM2 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828788] identity=72; qcov=1; evalue=1.34e-49; confidence=medium
Rice	`Os09g0133000` - identity=63.4; qcov=1.01; evalue=5.63e-42; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF02201 (SWIB); PF26291 (SWIB_eIF2D)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991290

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057771394.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771394.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771394.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771394.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771394.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:515049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr7:515071`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C26
`Chr7:515071`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C26
`Chr7:515120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr7:515891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,B85,C51,C57
`Chr7:515911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,C14,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771394.1

100 aa

100

SWIB

SWIB_eIF2D

PF02201 SWIB 24-95 aa PF26291 SWIB_eIF2D 48-87 aa

XP_057771395.1

100 aa

100

SWIB

SWIB_eIF2D

PF02201 SWIB 24-95 aa PF26291 SWIB_eIF2D 48-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771394.1`	Pfam	`PF02201`	SWIB	Domain	24	95	1e-19	70.7	SWIB/MDM2 domain
`XP_057771394.1`	Pfam	`PF26291`	SWIB_eIF2D	Domain	48	87	7.2e-07	29.5	eIF2D, SWIB domain
`XP_057771395.1`	Pfam	`PF02201`	SWIB	Domain	24	95	1e-19	70.7	SWIB/MDM2 domain
`XP_057771395.1`	Pfam	`PF26291`	SWIB_eIF2D	Domain	48	87	7.2e-07	29.5	eIF2D, SWIB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915411.1
CCCCTTCCTGCGCAGAAGGGCTGGCCCTGTGTGATGAATTGTAAATTCGAACTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGGAAGTAAATTCGAACTTTCATTTTCACTTTTCACGGTTGAATTGTTAAAAATTCACAATCAATCATTTCACAATCAGAATCAGGCAGCTGCTGTGAGTTCAGGTGCTTGAAATATACTAGTAAACTTGGGGAAAATGCTTCCACAAAGGTTGAAAAAGGCTGTTGCAGACAATCCCAAGAAA...

XM_057915412.1
GAAGGGCTGGCCCTGTGTGATGAATTGTAAATTCGAACTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGGGAAGTAAATTCGAACTTTCATTTTCACTTTTCACGGTTGAATTGTTAAAAATTCACAATCAATCATTTCACAATCAGAATCAGGCAGCTGCTGTGAGTTCAGGTAATACCCATTTCACAGCTCATCTCTTATTGCCAATCAATCATGCTTTATCAATTCTTTAACAGCTCCAATAATCCAACAAAAACCCAATTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991290
ATGCTTCCACAAAGGTTGAAAAAGGCTGTTGCAGACAATCCCAAGAAAGTTGCAAATTTGATTGACATTGTGAATTTGCCCACCGTGCTTAGAGATTTCATGGGCCAGTCTCAGAGTTCACAGCTCGGTTGCTTTAAGCGCGTTTGGGGTTATATCAGGGACAACAATCTCCAGGATCCAGTCAATAGAAACGTAGTCAACTGCGATCCGAAGCTGAAGAGCATTCTGTTGGGCAAGTCCACGATCGATCTCACCGAACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771394.1
MLPQRLKKAVADNPKKVANLIDIVNLPTVLRDFMGQSQSSQLGCFKRVWGYIRDNNLQDPVNRNVVNCDPKLKSILLGKSTIDLTELPPLIKLHFPKQPK

XP_057771395.1
MLPQRLKKAVADNPKKVANLIDIVNLPTVLRDFMGQSQSSQLGCFKRVWGYIRDNNLQDPVNRNVVNCDPKLKSILLGKSTIDLTELPPLIKLHFPKQPK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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