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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000099`

染色体: Chr07 坐标: 539750-544034 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000099`
名称	SmilChr07G000099
描述	CRM-domain containing factor CFM3A, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	539750 - 544034 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991294`
GeneID	`130991294`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991294`
原始查询	`SmilChr07G000099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CRM-domain containing factor CFM3A, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	CRM-domain containing factor CFM3A%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G23070` (CFM3A) CRM family member 3A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821881] identity=56.9; qcov=0.959; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0592400` (CFM3) - identity=58.7; qcov=0.803; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000375 (RNA splicing, via transesterification reactions); GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01985 (CRS1_YhbY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991294

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771404.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057771404.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771404.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771404.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771404.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:540005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B46,C39,C83
`Chr7:540017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B84,B90,B92
`Chr7:540039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C57
`Chr7:540078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:540720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B84,B90,B92
`Chr7:540769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr7:540801`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:540856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B140,B19,B86
`Chr7:541145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr7:541488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B104,B137,B78,B88
`Chr7:541490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B101,B119,C27
`Chr7:541492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B96,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771404.1

874 aa

437

874

CRS1_YhbY

PF01985 CRS1_YhbY 244-327 aa PF01985 CRS1_YhbY 447-531 aa PF01985 CRS1_YhbY 660-747 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771404.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	244	327	3.9e-56	188.1	CRS1 / YhbY (CRM) domain
`XP_057771404.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	447	531	3.9e-56	188.1	CRS1 / YhbY (CRM) domain
`XP_057771404.1`	Pfam	`PF01985`	CRS1_YhbY	Domain	660	747	3.9e-56	188.1	CRS1 / YhbY (CRM) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915421.1
ATCTTGATGAATACAAGATGATATTTGAAGAGGAGACAAAAGCCCACCATTAAACCTCCCCAAAAACCTTCAAAAATCGTCTTGTTTATTTCTTTTTGCAATTCTTCATCAATCTCTTTCTAAAATATCTGCTTCAGCAAACTTCTGTTCAAAAACAAGCTCAATTTTTCATGTCTAGTTTTAAATGTGCGTAGAATATGAGAATTGCTGTTGTGCCCAGCTACCAATTCTATCCACAAAATACCTTCTTGATGGATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991294
ATGAGAATTGCTGTTGTGCCCAGCTACCAATTCTATCCACAAAATACCTTCTTGATGGATTCATTGCAGAGCTCAGCGTGCAGATTCCATGTAAGAAAAACCCTAACCTTTTCGAATTCCACTTCTTACATTCCTGCCAAGAAACAGTTTTTTTCTGCAATTCATCACAGTGGCAACTCAGATTTCAGACCTAGGAAAAACCCTCGTAAAAGATTCAATCTTTTGCAGAAGAACAATGGTGGGGTCGGTTTTCCATGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771404.1
MRIAVVPSYQFYPQNTFLMDSLQSSACRFHVRKTLTFSNSTSYIPAKKQFFSAIHHSGNSDFRPRKNPRKRFNLLQKNNGGVGFPCEGSISSRSRVISSRGSWLDSWNVSGGGRPQAVVNYRHRGDVSSSDAEEGTSTSSGGSTMERIVEKLKKFGYIDDVSEESDDNKNVIEKGSVEDIFHVEEGLLPNTRGGFSKEFPFGDENASVGGNGEVSFPWEKSSTPNVPRRSVDSRQNRSLAELTLPQSELSRLRNLALKVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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