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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000103`

染色体: Chr07 坐标: 550201-556399 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000103`
名称	SmilChr07G000103
描述	phosphatidate cytidylyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	550201 - 556399 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991298`
GeneID	`130991298`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991298`
原始查询	`SmilChr07G000103`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidate cytidylyltransferase 1
产物	phosphatidate cytidylyltransferase 1
Arabidopsis	`AT1G62430` (CDS1) CDP-diacylglycerol synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842541] identity=78; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0758400` - identity=75.9; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004605 (phosphatidate cytidylyltransferase activity); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04070 (Phosphatidylinositol signaling system - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01148 (CTP_transf_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991298

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057771411.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057771411.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771411.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771411.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771411.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:550529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:550643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr7:550849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B68,B93,D10,D7
`Chr7:550965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B26
`Chr7:552324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr7:552509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:552828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:553155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:554095`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B66
`Chr7:554095`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771411.1

431 aa

216

431

CTP_transf_1

PF01148 CTP_transf_1 58-388 aa

XP_057771412.1

431 aa

216

431

CTP_transf_1

PF01148 CTP_transf_1 58-388 aa

XP_057771413.1

431 aa

216

431

CTP_transf_1

PF01148 CTP_transf_1 58-388 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771411.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	58	388	9e-79	265.7	Cytidylyltransferase family
`XP_057771412.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	58	388	9e-79	265.7	Cytidylyltransferase family
`XP_057771413.1`	Pfam	`PF01148`	CTP_transf_1	Family	58	388	9e-79	265.7	Cytidylyltransferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915429.1
ATCACGTTTGATTAATGTAATTAAGTTTGATTTAATCAACACCTACGACAAAACTTCACATAAGGCCCTCTTATTTATAGTTAATCACATTTTCAACCCCAAATCTCTTTTAGCGAAGAATCCCACCAATCCTCACGCATTTCCCCACTCCGTTGGACTTCTCCTTCTCCCTCTCTAGAGAGTAGAGAGAGAGGCGAAGGTCAGATCTCCCTCGCTCTTCAATCTCACTCAACGCGTCACCTTTTTATTGCTCAGCTACT...

XM_057915428.1
GCTCAGGTTTCGCTTTCTCTTCTCTATTCTCTGCTGCTACTTTTTTATTGTACGATTATGTGTCCATTTTTTTTGGAGCAATGCAACGTAGTTGCTGTTAATGGCGGCTGAAATTTCTTTAGCTCCGTGTTGTGAAGTTATTGCATATGTTCCGCCATTAATTTAAATTTAATTTTTCGAAATAAAAAAATTGGGTTTAAGTCGTGAAGATTTGTTGTTTGTCAGTTTTGATTTATGTTTTGCTATATATAACTGTGGTG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130991298
ATGCATAGAGAAACAATGGACAGGGATAATGGTTCTGGTGGTCCATCCACACCTAGTGGGCCTACTGCACGGTTACGTCGGCGGAAAGGCTCAAATGAGGTTCCTCCAGAAGTAGAAACAAACAGTGATCGTTTACTTTTCAATGACCGTAACAAGTACAAGTCAATGTTAATCCGCACATATTCAACTGTTTGGATGATTGGAGGATTTATCTCGATAATATACTTGGGTCACCTTTATATTTGGGCCATGGTAGTGGT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771411.1
MHRETMDRDNGSGGPSTPSGPTARLRRRKGSNEVPPEVETNSDRLLFNDRNKYKSMLIRTYSTVWMIGGFISIIYLGHLYIWAMVVVIQIFMAKELFNLLRKAHEDKQLPGFRLLNWHFFFTVMLFVYGRILSQRLVNTVTMDKFLYKLVGRLIKYHMVTCYFLYIAGFMWFILTLKKKMYKYQFSQYAWTHMILIVVFTQSAFTVANIFEGIFWFLLPASLIVINDIAAYIFGFFFGRTPLIKLSPKKTWEGFIGASFA...

XP_057771412.1
MHRETMDRDNGSGGPSTPSGPTARLRRRKGSNEVPPEVETNSDRLLFNDRNKYKSMLIRTYSTVWMIGGFISIIYLGHLYIWAMVVVIQIFMAKELFNLLRKAHEDKQLPGFRLLNWHFFFTVMLFVYGRILSQRLVNTVTMDKFLYKLVGRLIKYHMVTCYFLYIAGFMWFILTLKKKMYKYQFSQYAWTHMILIVVFTQSAFTVANIFEGIFWFLLPASLIVINDIAAYIFGFFFGRTPLIKLSPKKTWEGFIGASFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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