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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000118`

染色体: Chr07 坐标: 663221-665376 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000118`
名称	SmilChr07G000118
描述	uncharacterized SmilChr07G000118
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	663221 - 665376 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991311`
GeneID	`130991311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991311`
原始查询	`SmilChr07G000118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G22970; symbol=AT3G22970; hit=AT3G22970; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AT3G22970; symbol=AT3G22970; hit=AT3G22970; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G22970` (AT3G22970) - identity=55.4; qcov=1.04; evalue=4.33e-127; confidence=high
Rice	`Os03g0796600` - identity=49.3; qcov=0.776; evalue=6.34e-82; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04720 (PDDEXK_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991311

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771425.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771425.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771425.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771425.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771425.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:663859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C46,D3
`Chr7:663895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C82
`Chr7:663908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C4
`Chr7:663941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr7:664074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B94,C54
`Chr7:664096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,D8
`Chr7:664174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B46,B7
`Chr7:664322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:664411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:664413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:664808`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A13,C22,C57,C84
`Chr7:664808`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A13,C22,C57,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771425.1

366 aa

183

366

PDDEXK_6

PF04720 PDDEXK_6 66-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771425.1`	Pfam	`PF04720`	PDDEXK_6	Family	66	284	1.3e-76	258.1	PDDEXK-like family of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915442.1
AAATAGCCCAAAAATACACGAAACAAAGAAAAAGGAAACAGCAACCTCAAAAAGGAAAAACAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAAACTAGAAACTTCACACAACAAAAACACTCGTGATTTCAACATCCGACCTCCGCCGATGGAGTTCCGCCGGAAAATTACTTTTCCGGCATCTGATTCCGATTCCCCCCGCTACACTCATAATGCTCGCCTCTCCTTCCATCGCCGTCACGTTTTTCACGAAAAGCAATAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991311
ATGAGAATCCAGCCGATCGATTCGATCCCGAGCGACGCCGTCAAGCCGCCGGTGCTTAAGTCTCGGCTCAAGCGGCTTTTTGACCGTCCGTTCAACGGCGTCCTGCGGATTTCATCCGCTGAGAAGCCGGTCGCCGGAGGAGACAAAGATGGCGGTGGCGCCGCCGAGTTCGAGCCGAGCTCGGTCTGTTTGGATAAAATGGTTCAGAATTTCATGGAGGATAACAACGAGAAGCCTTCCTCCGCCGCCGCGAAATGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771425.1
MRIQPIDSIPSDAVKPPVLKSRLKRLFDRPFNGVLRISSAEKPVAGGDKDGGGAAEFEPSSVCLDKMVQNFMEDNNEKPSSAAAKCARNRCNCFNGNSNDSSDDELDFFSDSISANSSFGDPSDTLRSLTPCATVAERNLLADTSKIVEKNNKTYKRKDDLRKIVTDDLISLGYNASLCKSKWDKSPSIPSGEYEYIDVVVEGERVIIDVDFRSEFEIARSTSSYKAVLQNLPYIFVGKTDRLIQIVAIASEAARQSLKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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