当前解析结果
SmilChr07G000122| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000122 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000122 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000122 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 701916 - 703607 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991314 |
|---|---|
| GeneID | 130991314 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991314 |
| 原始查询 | SmilChr07G000122 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991314 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057771428.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057771430.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.40000 | XP_057771430.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057771428.1 |
| 5 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057771432.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:701987 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,B35 |
Chr7:701998 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B133 |
Chr7:702237 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B32,B78,B83,C33,C72 |
Chr7:702268 |
ATC |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 91 | A1,A18,A23,A24,A25,A4,A8,A9,B10,B102,B103,B104,B108,B11,B112,B114,B115,B124,B128,B129,B13,B135,B18,B2,B21,B25,B29,B3,B30,B32,B4,B40,B44,B47,B5,B50,B54,B57,B6,B62,B63,B66,B68,B7,B72,B73,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B87,B91,C11,C12,C16,C18,C19,C30,C31,C33,C36,C39,C4,C43,C45,C48,C49,C51,C53,C55,C6,C62,C65,C66,C69,C70,C74,C78,C79,C81,C84,D10,D3,D4,D5,D7,D8 |
Chr7:702288 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,C42 |
Chr7:702289 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B64,B93,C46,C82 |
Chr7:702289 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B64,B93,C46,C82 |
Chr7:702490 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B50,C42 |
Chr7:702492 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B32 |
Chr7:702494 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | B2,B49,B53,B60,B65,B79,C36,C63,C87 |
Chr7:702569 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 170 | A1,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A25,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B137,B138,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B28,B29,B30,B32,B33,B34,B35,B36,B4,B41,B44,B45,B46,B47,B50,B53,B54,B59,B6,B60,B63,B64,B65,B70,B71,B72,B73,B74,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C22,C23,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C42,C44,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C59,C60,C62,C63,C67,C7,C70,C73,C75,C76,C77,C79,C81,C82,C83,C84,C87,C9,D1,D11,D3,D4,D5,D6,D9 |
Chr7:702585 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 5 | A19,B19,B74,C42,C48 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
8 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。