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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000130`

染色体: Chr07 坐标: 767793-768818 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000130`
名称	SmilChr07G000130
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	767793 - 768818 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991324`
GeneID	`130991324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991324`
原始查询	`SmilChr07G000130`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975, chloroplastic
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At4g18975%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G04590` (AT1G04590) PPR containing-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839484] identity=59.1; qcov=0.88; evalue=1.86e-93; confidence=high
Rice	`Os11g0125500` - identity=54.3; qcov=0.811; evalue=4.67e-79; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057771446.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771446.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771446.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771446.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771446.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:767837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,A20,B121,B134
`Chr7:767863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr7:767874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A13,B122,B136,C61
`Chr7:767889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B103,C84
`Chr7:767889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C84
`Chr7:768001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B76,C52
`Chr7:768026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B112,B113,B8
`Chr7:768101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B81,C61,C75
`Chr7:768155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,B9
`Chr7:768212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C82
`Chr7:768219`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85
`Chr7:768219`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C85

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915463.1
ATGTCAAGAATAAGCTTTGTAACACGACTGGCCAAGCAGTTGAACCGAATCAATGTCGAGAGAGCTCAGCCCCTCTCTTCTCGTTGTAACGCTACGCGACACTCCACCTTCTCTAGCCAAAAGAATGAAGAGGAATCCATGAAGGACGCGAATGCTAGCCATTCCACGTCTCAGAACCGGATCAAAGGCATGGGAAGCGTGCCCCGTTGCCAAATAGGAGAGAATGTTCCGAGGAAGGACAAGATCAGCTTTCTCGTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991324
ATGTCAAGAATAAGCTTTGTAACACGACTGGCCAAGCAGTTGAACCGAATCAATGTCGAGAGAGCTCAGCCCCTCTCTTCTCGTTGTAACGCTACGCGACACTCCACCTTCTCTAGCCAAAAGAATGAAGAGGAATCCATGAAGGACGCGAATGCTAGCCATTCCACGTCTCAGAACCGGATCAAAGGCATGGGAAGCGTGCCCCGTTGCCAAATAGGAGAGAATGTTCCGAGGAAGGACAAGATCAGCTTTCTCGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771446.1
MSRISFVTRLAKQLNRINVERAQPLSSRCNATRHSTFSSQKNEEESMKDANASHSTSQNRIKGMGSVPRCQIGENVPRKDKISFLVSTLMDLPDSKEAVYSALDAWVAWERDFPIGALKNVLLALEKEQQWHRVVQVIKWMLSKGQGTTNGTYGQLIHALDMDNRVEEAQEIWKKKLGFDLHSVPWKLCNLVISMYYRNKMLEELVTLFKGLESFDRKPQEKSIVQKVSNAYELLGLPEEKERVLEKYKDLFEAKKTKKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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