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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000132`

染色体: Chr07 坐标: 785758-787182 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000132`
名称	SmilChr07G000132
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g51370-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	785758 - 787182 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993002`
GeneID	`130993002`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993002`
原始查询	`SmilChr07G000132`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g51370-like
产物	F-box/FBD/LRR-repeat protein At1g51370-like
Arabidopsis	`AT3G28410` (AT3G28410) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822470] identity=25.8; qcov=0.492; evalue=1.77e-09; confidence=low
Rice	`Os01g0789000` (OsFbox044) - identity=27.3; qcov=0.456; evalue=1.13e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993002

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773707.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773707.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773707.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773707.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:785758`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A1,A7,B104,B114,B119,B130,B140,B22,B38,B53,B69,B75,B79,C29,C31,C50,C9
`Chr7:785767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr7:785806`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B78,D10
`Chr7:785806`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B78,D10
`Chr7:785841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B42,B43
`Chr7:785844`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,B93
`Chr7:785890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B122,B24,C34,C79
`Chr7:785895`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr7:785932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B38,B40,B69,B79
`Chr7:785951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B133
`Chr7:785951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr7:785966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773707.1

362 aa

181

362

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 2-331 aa PF24758 LRR_At5g56370 19-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773707.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	2	331	1.1e-09	38.9	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057773707.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	19	152	3e-13	50.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917724.1
ATGCTGAAATTCTCCCTGTACCTGAATATTGATGATTCCTTAAACAGTGATATTCATTCATGGCTGCTTTTTGCAATTGAAAAACAAGTGGAGGAGGTGTCTATAGATTTGAATGGTTGGTATTTTAAACATGTTGCACCTCAGCGTTTGTATTCTTGCTCGTCTATTACAAAATTATCCCTTTCTTTTCTTAACCTGAAACCTGAGGACAAGGTGCAGTTGAATAATCTCAAGAGTTTAACCATTAGAGTTTACTATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993002
ATGCTGAAATTCTCCCTGTACCTGAATATTGATGATTCCTTAAACAGTGATATTCATTCATGGCTGCTTTTTGCAATTGAAAAACAAGTGGAGGAGGTGTCTATAGATTTGAATGGTTGGTATTTTAAACATGTTGCACCTCAGCGTTTGTATTCTTGCTCGTCTATTACAAAATTATCCCTTTCTTTTCTTAACCTGAAACCTGAGGACAAGGTGCAGTTGAATAATCTCAAGAGTTTAACCATTAGAGTTTACTATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773707.1
MLKFSLYLNIDDSLNSDIHSWLLFAIEKQVEEVSIDLNGWYFKHVAPQRLYSCSSITKLSLSFLNLKPEDKVQLNNLKSLTIRVYYSLSVDAMNQVISGAPHLEELILTYWEIGENLNIRSTSLKTLKIGQHACNVGETAVLRIWAPNLVTLEILGLNGGGCSLFVPSLTHAILSLKENDWTFKPFRIINQVFRSISHVEEFTLSEWCIKFLLSMENRNMYVPLSNAKFLKFYVREAEEILDVFVISPKLMHTIVDQRDN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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