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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000141`

染色体: Chr07 坐标: 842274-843785 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000141`
名称	SmilChr07G000141
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	842274 - 843785 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993007`
GeneID	`130993007`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993007`
原始查询	`SmilChr07G000141`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT3G26922` (AT3G26922) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922367] identity=28.1; qcov=0.595; evalue=2.25e-16; confidence=low
Rice	`Os01g0730200` (OsFbox036) - identity=23.7; qcov=0.595; evalue=2.1e-10; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993007

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773712.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773712.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773712.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773712.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773712.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:842399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B32,B41
`Chr7:842430`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B32,B41
`Chr7:842460`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	58	A11,A2,A22,A5,B101,B104,B105,B109,B113,B119,B136,B139,B15,B3,B33,B38,B39,B40,B47,B5,B55,B56,B60,B73,B76,B77,B83,B85,B88,B9,B96,B97,B98,B99,C11,C13,C15,C16,C19,C22,C24,C25,C27,C31,C38,C42,C46,C48,C49,C5,C56,C61,C69,C74,C85,C87,D10,D5
`Chr7:842464`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	60	A11,A2,A22,A5,B101,B104,B105,B109,B113,B119,B136,B139,B15,B21,B3,B33,B38,B39,B40,B47,B5,B55,B56,B60,B73,B76,B77,B83,B85,B88,B9,B96,B97,B98,B99,C13,C15,C16,C19,C22,C24,C25,C27,C31,C38,C42,C46,C48,C49,C5,C56,C59,C61,C69,C74,C85,C87,D10,D5,D9
`Chr7:842490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B49,B57,C56,D7
`Chr7:842561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B32,B41
`Chr7:842564`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A4,B83,B9,B99,C46,C69,C87,D9
`Chr7:842592`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B32,B41
`Chr7:842923`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A22,B10,B107,B108,B112,B113,B12,B120,B124,B140,B18,B4,B46,B93,B94,B97,C1,C12,C15,C33,C48,C54,C65,D5
`Chr7:842925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B140,B18,B97,C54
`Chr7:843041`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B113,B3,B40,B70,C48,C50
`Chr7:843110`	`C`	`CGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	45	A11,A16,A4,A7,B105,B110,B117,B12,B124,B128,B13,B16,B2,B3,B40,B43,B48,B5,B57,B58,B7,B71,B72,B74,B8,C10,C11,C17,C23,C3,C33,C36,C37,C40,C41,C48,C49,C58,C60,C7,C70,C71,C72,C78,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773712.1

467 aa

234

467

F-box

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 4-41 aa PF24758 LRR_At5g56370 136-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773712.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	4	41	0.00029	21.3	F-box domain
`XP_057773712.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	136	227	3.5e-09	37.4	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917729.1
ATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTTGTTGCCTATTACCAATGTTGTTAGGACAACAATTCTATCGAAGCGCTGGGAAAACCTTTGGACCTCCACACCCTACCTTAATTTATACCATGATTGGGAGGTTGTTGACGACTATGAAGATGAATCTATCCAAGAGCATCGAAACTTCCTTAATCGGGCCTTATTGTGCTGGAATGGGGTAAGGCTTCTGAAATTCAAGTTTGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993007
ATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTTGTTGCCTATTACCAATGTTGTTAGGACAACAATTCTATCGAAGCGCTGGGAAAACCTTTGGACCTCCACACCCTACCTTAATTTATACCATGATTGGGAGGTTGTTGACGACTATGAAGATGAATCTATCCAAGAGCATCGAAACTTCCTTAATCGGGCCTTATTGTGCTGGAATGGGGTAAGGCTTCTGAAATTCAAGTTTGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773712.1
MDRLSELPDSIIFHIFWLLPITNVVRTTILSKRWENLWTSTPYLNLYHDWEVVDDYEDESIQEHRNFLNRALLCWNGVRLLKFKFDSENEPYLSIYTDIDLWVGFAKHNRAEELYLHIQQFDTYVCNCDELNDAIYLVPQCLYSCSSLKVLSIKSCYFRIKGSVQWNHLKSLTIIDGFGVNGDVVNQILCGSPQLEVLIMPVVESGKSLCIRSTSLKQLSINKHIDDKSTSKTELRIWTPNLETLETDGLAYTTCLLMNV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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