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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000142`

染色体: Chr07 坐标: 846855-848978 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000142`
名称	SmilChr07G000142
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	846855 - 848978 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993008`
GeneID	`130993008`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993008`
原始查询	`SmilChr07G000142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
产物	F-box/LRR-repeat protein At3g26922-like
Arabidopsis	`AT5G56370` (AT5G56370) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835738] identity=26.6; qcov=0.994; evalue=6.11e-22; confidence=low
Rice	`Os08g0197400` (OsFbox424) - identity=31.4; qcov=0.358; evalue=3.44e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993008

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773713.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773713.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773713.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773713.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057773713.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:847183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B95,C19,C42
`Chr7:847306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,C1,C10,C33,C42
`Chr7:847440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:847918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B88
`Chr7:848221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B94,C33
`Chr7:848404`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B76,C80,C83,C85
`Chr7:848456`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,A8,B28,B71,C9
`Chr7:848456`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A1,A8,B28,B71,C9
`Chr7:848470`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	72	A10,A22,A3,A4,A5,A9,B10,B100,B111,B113,B114,B125,B132,B135,B136,B138,B139,B18,B2,B22,B23,B3,B38,B4,B40,B44,B47,B5,B53,B54,B55,B6,B60,B62,B63,B70,B73,B77,B83,B88,B9,B98,C11,C15,C17,C18,C19,C24,C25,C28,C34,C37,C38,C42,C46,C49,C51,C54,C59,C6,C61,C62,C69,C71,C74,C77,C82,C83,C85,C86,D10,D9
`Chr7:848473`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	62	A10,A22,A3,A4,A5,B10,B100,B111,B113,B114,B125,B135,B136,B138,B139,B18,B2,B22,B23,B3,B38,B4,B40,B44,B5,B54,B55,B60,B62,B63,B70,B73,B77,B83,B88,B9,B98,C11,C15,C17,C18,C19,C24,C25,C28,C34,C37,C46,C49,C54,C59,C6,C61,C69,C74,C77,C82,C83,C85,C86,D10,D9
`Chr7:848476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	62	A10,A22,A3,A4,A5,B10,B100,B111,B113,B114,B125,B135,B136,B138,B139,B18,B2,B22,B23,B3,B38,B4,B40,B44,B5,B54,B55,B60,B62,B63,B70,B73,B77,B83,B88,B9,B98,C11,C15,C17,C18,C19,C24,C25,C28,C34,C37,C46,C49,C54,C59,C6,C61,C69,C74,C77,C82,C83,C85,C86,D10,D9
`Chr7:848559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B72,C40,C49,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773713.1

472 aa

236

472

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 14-50 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 82-269 aa PF24758 LRR_At5g56370 106-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773713.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	14	50	5.4e-06	26.8	F-box domain
`XP_057773713.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	82	269	8.5e-08	32.7	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057773713.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	106	226	2.1e-12	47.9	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917730.1
ATGAAGACGCGTTCATCTCGAGAGGTTTTCATGGATCGACTCAGTCAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTTGATGCCTATGACTGATGTTGTTAGGACGACATTTCTATCGAAGCGCTGGAAAAACCTTTGGACTACCGCACCCTACCTTAATTTCTATGATACTGACGAGGAGGAGGATGATGCTACAGAGCTTCGAAACTTCGTTAATCGGGCCTTATTGCGGCGCTGGAATGGGGTAAGGGTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993008
ATGAAGACGCGTTCATCTCGAGAGGTTTTCATGGATCGACTCAGTCAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTTGATGCCTATGACTGATGTTGTTAGGACGACATTTCTATCGAAGCGCTGGAAAAACCTTTGGACTACCGCACCCTACCTTAATTTCTATGATACTGACGAGGAGGAGGATGATGCTACAGAGCTTCGAAACTTCGTTAATCGGGCCTTATTGCGGCGCTGGAATGGGGTAAGGGTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773713.1
MKTRSSREVFMDRLSQLPDSIIFHIFWLMPMTDVVRTTFLSKRWKNLWTTAPYLNFYDTDEEEDDATELRNFVNRALLRRWNGVRVLKLKVESFYELDDSINADTDLWVRFAKNNQAEELYLHMELLDYDRMQCNDWVPQCLYSCSSLKVLSMKYCEFRIKGNVQWNQLKSLTIIDGFGVTEDAINRILCGSPRLEVLIMSVVESGFTLCIRSTSLKELSIYNHIFDICVNTCPTELKIWTPNLKTLKIEGSPYDKCLLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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