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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000155`

染色体: Chr07 坐标: 916953-922746 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000155`
名称	SmilChr07G000155
描述	putative F-box protein At1g49610
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	916953 - 922746 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991341`
GeneID	`130991341`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991341`
原始查询	`SmilChr07G000155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At1g49610
产物	putative F-box protein At1g49610
Arabidopsis	`AT5G02930` (AT5G02930) F-box/RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831737] identity=25.5; qcov=1; evalue=3.33e-24; confidence=low
Rice	`Os11g0209100` (OsFbox591) - identity=25.6; qcov=0.796; evalue=1.14e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991341

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771478.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771478.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771478.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771478.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771478.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:917119`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B136,B17
`Chr7:917169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr7:917185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:917189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr7:917207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B68
`Chr7:917263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:917299`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	80	A21,A23,A24,A3,A6,A8,A9,B105,B106,B110,B113,B117,B120,B121,B125,B128,B13,B137,B18,B21,B22,B27,B28,B29,B30,B34,B4,B44,B48,B5,B50,B54,B58,B6,B60,B63,B66,B71,B74,B76,B77,B78,B8,B80,B83,B86,B89,B93,B99,C1,C13,C15,C19,C20,C22,C24,C26,C28,C33,C39,C40,C41,C5,C52,C55,C58,C60,C64,C67,C68,C72,C73,C76,C78,C81,C84,C9,D2,D4,D9
`Chr7:917302`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	73	A21,A23,A24,A25,A3,A6,A8,A9,B10,B105,B106,B110,B113,B117,B121,B123,B125,B128,B137,B18,B22,B24,B28,B29,B30,B34,B44,B48,B5,B50,B54,B58,B60,B63,B66,B71,B74,B76,B77,B78,B8,B80,B83,B86,B99,C1,C13,C15,C19,C20,C22,C26,C28,C39,C40,C41,C5,C52,C55,C58,C63,C64,C67,C68,C72,C76,C78,C81,C84,C9,D2,D4,D9
`Chr7:917309`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A1,A14,A15,B1,B10,B103,B106,B115,B123,B17,B20,B26,B42,B68,B7,B70,C10,C11,C16,C18,C36,C46,C56,C63,C69,C82,C86,C87,D10
`Chr7:917312`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A1,A15,B1,B10,B103,B106,B115,B123,B17,B20,B26,B42,B68,B7,B70,C10,C11,C16,C18,C36,C46,C56,C63,C69,C82,C86,C87,D10
`Chr7:917313`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A1,A15,B1,B10,B103,B106,B115,B123,B17,B20,B26,B42,B68,B7,B70,C10,C11,C16,C18,C36,C44,C46,C56,C63,C69,C82,C86,C87,D10
`Chr7:917357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B65,C48,C8,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771478.1

476 aa

238

476

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 14-50 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 82-216 aa PF24758 LRR_At5g56370 105-219 aa

XP_057771479.1

466 aa

233

466

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 4-40 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 72-206 aa PF24758 LRR_At5g56370 95-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771478.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	14	50	2.6e-05	24.7	F-box domain
`XP_057771478.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	82	216	8.7e-10	39.2	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057771478.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	105	219	3.7e-17	63.5	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057771479.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	4	40	2.5e-05	24.7	F-box domain
`XP_057771479.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	72	206	8.7e-10	39.2	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057771479.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	95	209	3.7e-17	63.5	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915496.1
TTTGGATTTGCCGTCTTAACATCTGCTATCCAACGCTTAAGTTTCAACTTCAAGTCTTCAATGTCTTGTCAGTCTCGTGTGTTTGTTGTTCATTAGCTCAAACAAGGGTTTTGTTGGCGCGAGAGCGAAGAAGCGTTCATCTTGAGAGGGTTTCATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTCGTTGCCTATGACTGATGTTGTTAGGACAACGATTCTATCGAAGCGCTGGAAAA...

XM_057915495.1
AGTATCTTTTACTTGGATTTGCCGTCTTATCATCTGCTATCCAACGCTTAAATTTTCAACTTAAATGCCTTTTCAGTGTCGTGTGTTATGTTCATTAGCTGAAGCAAGGGTTTTGTTGGCGCGAGAATGAAGAAGCGTTCATCTCGAGAGGGTTTCATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTCGTTGCCTATGACTGATGTTGTTAGGACAACGATTCTATCGAAGCGCTGGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991341
ATGAAGAAGCGTTCATCTCGAGAGGGTTTCATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTCGTTGCCTATGACTGATGTTGTTAGGACAACGATTCTATCGAAGCGCTGGAAAAACCTTTGGACCACTGCACCATACCTTAATTTCGACAATGGTGCTATGGAATTTGGAGATGATAGAAAGCTTGAAAACTTCATTAATCGGGCCTTATTGCGCTGGAAGGGGGTAAGGGTTCTGAA...

LOC130991341
ATGGATCGACTCAGTGAGTTGCCGGACTCGATAATATTTCACATATTTTGGTCGTTGCCTATGACTGATGTTGTTAGGACAACGATTCTATCGAAGCGCTGGAAAAACCTTTGGACCACTGCACCATACCTTAATTTCGACAATGGTGCTATGGAATTTGGAGATGATAGAAAGCTTGAAAACTTCATTAATCGGGCCTTATTGCGCTGGAAGGGGGTAAGGGTTCTGAAATTCAAGTTCAAATCGGGTTATGAGTTTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771478.1
MKKRSSREGFMDRLSELPDSIIFHIFWSLPMTDVVRTTILSKRWKNLWTTAPYLNFDNGAMEFGDDRKLENFINRALLRWKGVRVLKFKFKSGYEFDESMYVGIDFWVQFAKDKEVEELYLDIILFDDIYWLPQCLHSCSSLKVLSFKNCNFRVYGDVQWNQLKSLTIIDGFGVTEHVINQILYGSPRLEVLILSFVDRGENLCIRSTSLKVLSIHKSLYFPGDPCWDSELRICTPNLETLEIKGVPHKKCLLVNVSSLT...

XP_057771479.1
MDRLSELPDSIIFHIFWSLPMTDVVRTTILSKRWKNLWTTAPYLNFDNGAMEFGDDRKLENFINRALLRWKGVRVLKFKFKSGYEFDESMYVGIDFWVQFAKDKEVEELYLDIILFDDIYWLPQCLHSCSSLKVLSFKNCNFRVYGDVQWNQLKSLTIIDGFGVTEHVINQILYGSPRLEVLILSFVDRGENLCIRSTSLKVLSIHKSLYFPGDPCWDSELRICTPNLETLEIKGVPHKKCLLVNVSSLTHATLGFFGLH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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