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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000166`

染色体: Chr07 坐标: 1006770-1011007 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000166`
名称	SmilChr07G000166
描述	protein LIKE EARLY STARVATION, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1006770 - 1011007 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991356`
GeneID	`130991356`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991356`
原始查询	`SmilChr07G000166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LIKE EARLY STARVATION, chloroplastic
产物	protein LIKE EARLY STARVATION%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G55760` (AT3G55760) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824742] identity=54.8; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0586300` - identity=56.8; qcov=0.821; evalue=1.01e-174; confidence=high
GO	GO:0005982 (starch metabolic process); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0043036 (starch grain); GO:2000904 (regulation of starch metabolic process); GO:2001070 (starch binding)
KEGG	-
Pfam	PF28232 (LESV)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991356

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771506.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057771506.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771506.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771506.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771506.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1007894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr7:1007896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr7:1008012`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B112,B120,C25
`Chr7:1008028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,D2,D6
`Chr7:1009130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:1009185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B94,C28,C73
`Chr7:1009290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C13
`Chr7:1009338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C13
`Chr7:1009560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:1009578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C43,C74,C83
`Chr7:1010536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B104,B44,C13
`Chr7:1010625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B41,C10,C50,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771506.1

577 aa

288

577

LESV

PF28232 LESV 308-553 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771506.1`	Pfam	`PF28232`	LESV	Domain	308	553	4.2e-97	325.0	Like early starvation, chloroplastic

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915523.1
ATGTAAAAGAGTAGCTTCATTCTTTCACTGGAGATGGGTCTAACCCGACCCAACTCCATGTGGTAGGAGAGGAGTGGCCGACGGAGCGCCAGCGAGTGGCTGGCAGAGCAGCGGCACAGACGTGATGCATGGGGTGTGCCGATTGCAACTTTGCAAGGAAAGGTTGCATGGACGCATAATATTCCAAAATAGGGTATGCATAATTTTGAGGAACAAATGAACTAATAAACATAAAAAATGTAATATTTGTTAAAAAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991356
ATGGCCACTCATTTCCACCCATCTCACTCCCGCGCCGCGGCGGCGCTCCGCCGCCGGAGCGGGGCGAGCCCTTTTTTCATCTTCCCGCAGCAGGCGCTCCCGTGGCGCTCCAGGCATGTTCTAGGGAATCAAAGCGGCGCGATGAGCATTTCAAGAATCAAGGCGGCGAGCTCGAGTGAGAGTGGAGACTCGTACCTGGACATGTGGAAGAAGGCGAGGGAGCGCGAGCGGAGCTCTATGGAGTTTCAGATACTGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771506.1
MATHFHPSHSRAAAALRRRSGASPFFIFPQQALPWRSRHVLGNQSGAMSISRIKAASSSESGDSYLDMWKKARERERSSMEFQILAENSAEAAENAGEESAEELEKRNREFEKLLEVPAEERDKVQRMQVIDRAAAAIAAARALLKDTAPPQPDIASGGAEMDDLDEGRENGSTLEAQFSSSTIGTPGPSFWAWAPPLQDDDNDDSFMSGQLKPATQASPFAAQSSPVLEQERSQESLSIPFETAMLQSQNLVPPLQSLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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