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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000192`

染色体: Chr07 坐标: 1207942-1209912 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000192`
名称	SmilChr07G000192
描述	acireductone dioxygenase 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1207942 - 1209912 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991385`
GeneID	`130991385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991385`
原始查询	`SmilChr07G000192`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	acireductone dioxygenase 1-like
产物	acireductone dioxygenase 1-like
Arabidopsis	`AT5G43850` (ARD4) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834407] identity=76.1; qcov=0.957; evalue=7.62e-102; confidence=high
Rice	`Os03g0161800` (Sip2A) - identity=63.1; qcov=0.957; evalue=6.43e-87; confidence=high
GO	GO:0010309 (acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring] activity); GO:0019509 (GO:0019509)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02311 (AraC_binding); PF03079 (ARD); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771554.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771554.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057771554.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057771554.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771554.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1208149`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	C41,C45,C8
`Chr7:1208149`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C41,C45,C8
`Chr7:1208158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:1208167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B112,B73,D10
`Chr7:1208179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B112,B30,C1,C25
`Chr7:1208194`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B3,B4,C15
`Chr7:1208194`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B3,B4,C15
`Chr7:1208210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B4,C15,C21
`Chr7:1208234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:1208236`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B3,B4,C12,C15,C21
`Chr7:1208236`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B3,B4,C12,C15,C21
`Chr7:1208392`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771554.1

184 aa

184

ARD

AraC_binding

Cupin_2

PF03079 ARD 5-158 aa PF02311 AraC_binding 85-141 aa PF07883 Cupin_2 88-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771554.1`	Pfam	`PF03079`	ARD	Domain	5	158	1.2e-58	198.5	ARD/ARD' family
`XP_057771554.1`	Pfam	`PF02311`	AraC_binding	Domain	85	141	1e-07	32.5	AraC-like ligand binding domain
`XP_057771554.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	88	142	5.5e-09	36.3	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915571.1
GGGTGTCCTTTTGCATCTTGCTCTAGAATTTTCATGCTCAATATAATCTGTGGATTTTTTTAGAAGCTTCACAAAAGGTTAAATAAATCAATACCACCAAAATCGGATGGCCAATAATCTCCCACATGGCAAATGCCCTCAAATAAATCCAAACAATTATGAATTTATTTTAGGCCTTACCAACCATTGACCTAAGCAATCGAGTGAGCCAGTTGTTTCTCAAAATTTTCGACTCCCATGGCGATTGAGGCATGGTTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991385
ATGGCGATTGAGGCATGGTTTATGCAAGAAAATGATGATGATCAAAGGCTCCCGCATCAAAAGGACCCGCCCGAATACGTTTCGTCGGGTCAGTTGGCGGATCTTGGAGTTCTCTACTGGAATTTGGATCCGGATCGGTATGAGAATGACCCGGAACTGAACAAGATCAGGCAAGAGAGGGGATATAGTTATATGGATATGCTTGATTTGTGTCCCGAGAAGGTGGAGAACTACGAGGAGAAGCTCAAGAATTTTTACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771554.1
MAIEAWFMQENDDDQRLPHQKDPPEYVSSGQLADLGVLYWNLDPDRYENDPELNKIRQERGYSYMDMLDLCPEKVENYEEKLKNFYTEHIHGDEEIRYCLKGSGYFDVRDKDDRWIRILIKPGDLIVLPAGIYHRFTLDTSNYIKLMRLFVGEPVWTPFNRPQGNHPARKGYVKSMLGMPLEAY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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