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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000196`

染色体: Chr07 坐标: 1230491-1233067 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000196`
名称	SmilChr07G000196
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1230491 - 1233067 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993015`
GeneID	`130993015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993015`
原始查询	`SmilChr07G000196`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT1G59620` (CW9) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842252] identity=31; qcov=0.854; evalue=1.29e-74; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=32.5; qcov=0.747; evalue=1.98e-76; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057773719.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057773719.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057773719.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773719.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773719.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1230517`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A24,B1,B111,B130,B25,B31,B43,B60,B63,B69,B72,B82,B94,B96,C27,C28,C29,C38,C51,C56,C58,C62,C63,C68,C74,C78,D2,D3
`Chr7:1230519`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A24,B111,B43,B63,B82,C56,C63,C68,C74,D2
`Chr7:1230525`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C74
`Chr7:1230525`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C74
`Chr7:1230530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:1230572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,D8
`Chr7:1230575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr7:1230577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B31,D8
`Chr7:1230578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,A7,B1,C2,C62
`Chr7:1230607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C36,C66
`Chr7:1230611`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr7:1230611`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773719.1

858 aa

429

858

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 148-319 aa PF23559 WHD_DRP 402-473 aa PF23598 LRR_14 533-830 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773719.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	148	319	2.6e-42	145.1	NB-ARC domain
`XP_057773719.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	402	473	2e-20	73.3	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057773719.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	533	830	4.5e-15	56.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917736.1
ATGGCATACAATCTTCAATCCCTCATCACCATCCTTCAAGGAATTCTGGATCCCGAACAAACACACTGGATTCTTGGACGTGAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCGAAAAAGCTTCTTACCTGCAGCAGCAGATTCTCGAAAAAACTCCACTACTCTCCAAAATACCAAGCTTGGAGTGCCAAATCAGAGACGTAGCAAATGAAGCAGAAGATATCGTTGAATCTCACATGGTTGAACGAATGCTCTCGATGCCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993015
ATGGCATACAATCTTCAATCCCTCATCACCATCCTTCAAGGAATTCTGGATCCCGAACAAACACACTGGATTCTTGGACGTGAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCGAAAAAGCTTCTTACCTGCAGCAGCAGATTCTCGAAAAAACTCCACTACTCTCCAAAATACCAAGCTTGGAGTGCCAAATCAGAGACGTAGCAAATGAAGCAGAAGATATCGTTGAATCTCACATGGTTGAACGAATGCTCTCGATGCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773719.1
MAYNLQSLITILQGILDPEQTHWILGREKPQLQSLLEKASYLQQQILEKTPLLSKIPSLECQIRDVANEAEDIVESHMVERMLSMPEGVNITPLTPDVLLVTQKLDSLTQQVEELVEVERNKKPTGSSWSGASFSSSKNVVVGVNEVLMQLKDRLTGMQSKLEILPIVGMGGIGKTTLARTLYQDPLILEHFSYLAWTTVSQDYNMRSILLSLLRCIIGKEECDQHNEKGDGELKDILYRSLCGRRYMIVLDDIWSTKFW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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