Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000202`

染色体: Chr07 坐标: 1263408-1265809 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000202`
名称	SmilChr07G000202
描述	uncharacterized SmilChr07G000202
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1263408 - 1265809 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991402`
GeneID	`130991402`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991402`
原始查询	`SmilChr07G000202`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991402

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771591.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057771591.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771593.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771591.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771591.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1264709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B55
`Chr7:1264783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:1264816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,C23,C36
`Chr7:1264831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:1264848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B121,B66,B8
`Chr7:1264873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr7:1264887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C38,C39,C43
`Chr7:1264904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:1264914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:1264921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B62,B7,C34,C77
`Chr7:1264948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr7:1264985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915610.1
AGACTAAAATGCCCCTCCTTAAAAATGGGCAATTCTCGCCCCAGCTTCAGAAATTCAGAATTTCTTCAATCTGCACTATCTCTCTCTCTCAATTACCATACCCCGGCAACTACGTCCATTCCCCGGCGAGTCGCGGCGGCGGCGGCAATAGCGGTTTATCGGCGAAGAGTGGATTGCCGGAGATCGAAGGGAGTGGATTTTTTATTTTGGGATCTAGGGTTCGAGTGATTTTCGATTTTTTTTCTGGTTCTAGATCAATT...

XM_057915608.1
AGACTAAAATGCCCCTCCTTAAAAATGGGCAATTCTCGCCCCAGCTTCAGAAATTCAGAATTTCTTCAATCTGCACTATCTCTCTCTCTCAATTACCATACCCCGGCAACTACGTCCATTCCCCGGCGAGTCGCGGCGGCGGCGGCAATAGCGGTTTATCGGCGAAGAGTGGATTGCCGGAGATCGAAGGGAGTGGATTTTTTATTTTGGGATCTAGGGTTCGAGTGATTTTCGATTTTTTTTCTGGTTCTAGATCAATT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130991402
ATGCCCCTCCTTAAAAATGGGCAATTCTCGCCCCAGCTTCAGAAATTCAGAATTTCTTCAATCTGCACTATCTCTCTCTCTCAATTACCATACCCCGGCAACTACGTCCATTCCCCGGCGAGTCGCGGCGGCGGCGGCAATAGCGGTTTATCGGCGAAGAGTGGATTGCCGGAGATCGAAGGGAGTGGATTTTTTATTTTGGGATCTAGGGTTCGAGTGATTTTCGATTTTTTTTCTGGTTCTAGATCAATTTCCTTGAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771591.1
MPLLKNGQFSPQLQKFRISSICTISLSQLPYPGNYVHSPASRGGGGNSGLSAKSGLPEIEGSGFFILGSRVRVIFDFFSGSRSISLSTLEDFKNFLAPVHPAKTQLLESDTVSDLTSTLSSSSVTATPYKHISIETPYTDKSEMDSLKMGGSVEAEVVIKHLREARVQVSKSKDVGPSKNVVEALINIIIEEFRGSVYEEDEWLDKLLSSKRNQVFLICIMVLFSLLMVWFLSSSSNGSFTRPKPT

XP_057771592.1
MPLLKNGQFSPQLQKFRISSICTISLSQLPYPGNYVHSPASRGGGGNSGLSAKSGLPEIEGSGFFILGSRVRVIFDFFSGSRSISLSTLEDFKNFLAPVHPAKTQLLESDTVSDLTSTLSSSSVTATPYKHISIETPYTDKSEMDSLKMGGSVEAEVVIKHLREARVQVSKSKDVGPSKNVVEALINIIIEEFRGSVYEEDEWLDKLLSSKRNQVFLICIMVLFSLLMVWFLSSSSNGSFTRPKPT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器