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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000213`

染色体: Chr07 坐标: 1370238-1371513 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000213`
名称	SmilChr07G000213
描述	protein SLOW GREEN 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1370238 - 1371513 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991411`
GeneID	`130991411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991411`
原始查询	`SmilChr07G000213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SLOW GREEN 1, chloroplastic
产物	protein SLOW GREEN 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G18420` (AT3G18420) Protein prenylyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821371] identity=57; qcov=0.858; evalue=1.85e-106; confidence=high
Rice	`Os05g0182100` - identity=34.4; qcov=0.58; evalue=1.07e-30; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13174 (TPR_6); PF13181 (TPR_8); PF13432 (TPR_16); PF14559 (TPR_19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771609.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057771609.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.40000	`XP_057771609.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057771609.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771609.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1370408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr7:1370463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:1370465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr7:1370472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:1370499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,C12,C15,C21,C47
`Chr7:1370504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B140,C66
`Chr7:1370532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B4,C12,C15,C21
`Chr7:1370555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:1370580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr7:1370692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:1370737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C41
`Chr7:1370755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771609.1

331 aa

166

331

TPR_19

TPR_6

TPR_8

TPR_16

TPR_8

PF14559 TPR_19 150-199 aa PF13174 TPR_6 171-198 aa PF13181 TPR_8 171-198 aa PF13432 TPR_16 171-210 aa PF13181 TPR_8 278-307 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771609.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	150	199	5.5e-13	49.7	Tetratricopeptide repeat
`XP_057771609.1`	Pfam	`PF13174`	TPR_6	Repeat	171	198	6.9e-09	36.5	Tetratricopeptide repeat
`XP_057771609.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	171	198	2.2e-07	31.2	Tetratricopeptide repeat
`XP_057771609.1`	Pfam	`PF13432`	TPR_16	Repeat	171	210	1.1e-08	36.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057771609.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	278	307	2.2e-07	31.2	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915626.1
GCAAAATTGCAGAAACTTCTTTTTCTTCTTCCACCTTCACAATTCCCCAAATCACAAAACCCTTAAAATCCCACCTCCAAAAATGAACTCCACTCTCTCAATCTCCGCGCCTTTATTGCCGCCGCCGCTCTCCGCCCAGAGCTCCGTCGCGACCCGCATTCTCCGCTCAGCTCCTATCCTTTTCTCAAACAAGAAGAATTTCACTATCAAAGCCTCCTCCACCTCCGCCGCCGGCTCCTCAATCAACCCCACCCCTCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991411
ATGAACTCCACTCTCTCAATCTCCGCGCCTTTATTGCCGCCGCCGCTCTCCGCCCAGAGCTCCGTCGCGACCCGCATTCTCCGCTCAGCTCCTATCCTTTTCTCAAACAAGAAGAATTTCACTATCAAAGCCTCCTCCACCTCCGCCGCCGGCTCCTCAATCAACCCCACCCCTCCCACCCCGCCAAACCCCTTCATTCCCCACCTAAAGGCCGCCGTCTGCGCCGTCGTATTCGCCGCCGCGACATTCTCAAAGTTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771609.1
MNSTLSISAPLLPPPLSAQSSVATRILRSAPILFSNKKNFTIKASSTSAAGSSINPTPPTPPNPFIPHLKAAVCAVVFAAATFSKFPGPAGAELPRQSETLTVTIGREDIQQEDDSAQNSHLTQLLESSPEAIDALKKLVKEKLDAGEDGESLSILRKLSAAQPDNPDWKFMIARLLSEMGRIEEARDAFEEILSRNPLCFEALFENALLMDRSGEREEVMRRLQEALGVAESEMKAKEARDVRLIMAQMQFLHKDVEEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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