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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000223`

染色体: Chr07 坐标: 1422921-1426219 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000223`
名称	SmilChr07G000223
描述	uncharacterized SmilChr07G000223
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1422921 - 1426219 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991418`
GeneID	`130991418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991418`
原始查询	`SmilChr07G000223`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000]; symbol=AT1G31150; hit=AT1G31150; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT1G31150` (AT1G31150) K-box region protein (DUF1985) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840000] identity=25; qcov=0.225; evalue=1.6e-09; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771616.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771616.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771616.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771616.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771616.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1423252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:1423395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B9,C4,C54
`Chr7:1424076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr7:1424199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr7:1424202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B33,B63,B83
`Chr7:1424208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C4,C58
`Chr7:1424208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,C58
`Chr7:1424234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr7:1424272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C19
`Chr7:1426086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771616.1

818 aa

409

818

DUF1985

Peptidase_C48

PF09331 DUF1985 16-136 aa PF02902 Peptidase_C48 693-809 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771616.1`	Pfam	`PF09331`	DUF1985	Family	16	136	7.7e-12	46.1	Domain of unknown function (DUF1985)
`XP_057771616.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	693	809	6.7e-14	53.0	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915633.1
ACCTTTGGTCTTTAAACCTGTTACGGCAGCATCTTTCGGCCCAGAACTTTGCTCATGTACGTAGGTCTTGTTTCGGACCTTTGTTTGATATATTAAATTTAGAGTTTCAGGGGCAACTTTATAATGTCATGTGCCGTCGATTGCAAAGTGCGTCAGAAGAAAGATTCGTATTGCAATATCGAATTGGTAATTATGTCGTTGATTTTGGACCCGCTGATTTTGCCATAATGACCGGCTTGCGGTTCAATGGCATCACTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991418
ATGTGCCGTCGATTGCAAAGTGCGTCAGAAGAAAGATTCGTATTGCAATATCGAATTGGTAATTATGTCGTTGATTTTGGACCCGCTGATTTTGCCATAATGACCGGCTTGCGGTTCAATGGCATCACTACTCTCCCTGAAACTTCTAGTTTCCACGAAACTGTTTTTAGTGGGCAACGTTATTTGCGGGTGATTAGCATCGAAAATAAGTTCCTCAAAGAATGCAAACAAACATCTGGTACCTCAGAAACAAGCTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771616.1
MCRRLQSASEERFVLQYRIGNYVVDFGPADFAIMTGLRFNGITTLPETSSFHETVFSGQRYLRVISIENKFLKECKQTSGTSETSLKLGYLYIVYGLLVLKDRTQKNIDLGFIHLMDDLDRFLRYPWGRIAYDFLVPRTHNARKLIHKMETKQNKLSVEAYGFVHVLQAWMYEIMPSLAGFCGKQVIEHENRIPRMQRWSADSGILFEHLWPYFLPRAGNDPVPIIVSAQEYEMMDELGIPSTMHPASPTLVFNSKSLVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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