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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000226`

染色体: Chr07 坐标: 1453637-1454995 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000226`
名称	SmilChr07G000226
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 6
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1453637 - 1454995 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991423`
GeneID	`130991423`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991423`
原始查询	`SmilChr07G000226`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat extensin-like protein 6
产物	leucine-rich repeat extensin-like protein 6
Arabidopsis	`AT3G22800` (AT3G22800) Leucine-rich repeat (LRR) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821851] identity=62.8; qcov=0.93; evalue=7.01e-160; confidence=high
Rice	`Os03g0795300` (OSJNBb0021G19.14) - identity=60.1; qcov=0.855; evalue=3.64e-141; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991423

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057771621.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057771621.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771621.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771621.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771621.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1453901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:1453917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:1453943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:1453961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:1453968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:1453973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:1453984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr7:1454000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,C23
`Chr7:1454022`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:1454056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,C36,C6,C79
`Chr7:1454183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B11,B17,C28,C43
`Chr7:1454201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771621.1

387 aa

194

387

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 45-77 aa PF00560 LRR_1 113-134 aa PF13855 LRR_8 113-171 aa PF00560 LRR_1 137-153 aa PF00560 LRR_1 255-277 aa PF00560 LRR_1 279-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771621.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	45	77	0.00018	22.4	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057771621.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	113	134	8.8e-20	67.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057771621.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	113	171	3.9e-16	59.3	Leucine rich repeat
`XP_057771621.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	137	153	8.8e-20	67.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057771621.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	255	277	8.8e-20	67.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057771621.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	279	301	8.8e-20	67.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915638.1
AAACCTAATTTAATTAATCATCTAATCTTGAACAACACACTTATATAAACACCTCACTATTATCAACCCTCCAAATTAAAACAACAAAATGAAAATCTCATCACCATTTCTAGGATTATTACTACTAATCCTCACACTAATTTCCTTCACTAATCCATCTCATCAACAACCCTATTCTCCACCTCAAATACAAAACCCTAGACTCCTCAATGCCTTCATAGCCCTCCAAGCTTGGAAGCATGCCATCACCGGCGACCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991423
ATGAAAATCTCATCACCATTTCTAGGATTATTACTACTAATCCTCACACTAATTTCCTTCACTAATCCATCTCATCAACAACCCTATTCTCCACCTCAAATACAAAACCCTAGACTCCTCAATGCCTTCATAGCCCTCCAAGCTTGGAAGCATGCCATCACCGGCGACCCCAAGAACTTCACCGCCGGCTGGCGCGGCCCCGACGTGTGCCGCTACGCCGGCGTCTACTGCGCCCCGGCCCCCGACGACCCCCACGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771621.1
MKISSPFLGLLLLILTLISFTNPSHQQPYSPPQIQNPRLLNAFIALQAWKHAITGDPKNFTAGWRGPDVCRYAGVYCAPAPDDPHATTVAGIDLNHAGIAGTLPEELGLLADLAVLHLNSNRFTGGLPGGLRHLRLLYELDVSNNRLSGGFPAVVLCLPSLKFLDIRYNKFAGDVPGELFDMKLDAIFVNNNRFKLTLPRNLGNSTASVLVLANNDLRGCIPPEIGKMANTLNEIILMNAGLAGCLPEEVGKLVKLTVFD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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