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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000234`

染色体: Chr07 坐标: 1512203-1521183 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000234`
名称	SmilChr07G000234
描述	uncharacterized SmilChr07G000234
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1512203 - 1521183 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991432`
GeneID	`130991432`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991432`
原始查询	`SmilChr07G000234`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-DIRECTED DNA METHYLATION 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821839]; symbol=RDM1; hit=AT3G22680; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RNA-DIRECTED DNA METHYLATION 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821839]; symbol=RDM1; hit=AT3G22680; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G22680` (RDM1) RNA-DIRECTED DNA METHYLATION 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821839] identity=57.6; qcov=0.443; evalue=5.3e-57; confidence=low
Rice	`Os06g0630300` - identity=51.7; qcov=0.504; evalue=2.9e-52; confidence=medium
GO	GO:0000419 (RNA polymerase V complex); GO:0005634 (nucleus); GO:0044030 (GO:0044030)
KEGG	-
Pfam	PF09187 (RdDM_RDM1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991432

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057771641.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771641.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771641.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771641.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771641.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1512386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,B98
`Chr7:1512401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B131,B139,B74
`Chr7:1512422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C29
`Chr7:1512423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:1512494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C39
`Chr7:1512502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr7:1512509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:1512535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr7:1512539`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C43
`Chr7:1512550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:1512575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C11,C69
`Chr7:1512600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771641.1

341 aa

170

341

RdDM_RDM1

PF09187 RdDM_RDM1 220-338 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771641.1`	Pfam	`PF09187`	RdDM_RDM1	Domain	220	338	2.3e-59	199.3	RNA-directed DNA methylation 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915658.1
GCCTATATCCTTTGTGAGTGAGAAGAGATCAGAGAAATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAATCCTCAACAATCGCACTGGATTGTTGATCACAACAAACCGCAACTCGAATCCCTCCTCGGAAAAGCTGCTTCTCTGCAGCAGATTCTTGAAAAATCTTCACCCTCCAAAATTATAGAGAATTTGGAAAGTCAAATCCAAGAAGCAGCACATAGAGCTGAAGACATCATTGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991432
ATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAATCCTCAACAATCGCACTGGATTGTTGATCACAACAAACCGCAACTCGAATCCCTCCTCGGAAAAGCTGCTTCTCTGCAGCAGATTCTTGAAAAATCTTCACCCTCCAAAATTATAGAGAATTTGGAAAGTCAAATCCAAGAAGCAGCACATAGAGCTGAAGACATCATTGAATCTCAGATGGTTGCTCAAATGCTTTCCAGCCCTGAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771641.1
MAYNLQPLITILQQILNPQQSHWIVDHNKPQLESLLGKAASLQQILEKSSPSKIIENLESQIQEAAHRAEDIIESQMVAQMLSSPEGVRFTFSTPDLQQVIQQLDSVMEQVVKLVEGKTMPSGSSPSGASLLQDPSSKSVVVGVDEDLMQLKDRLIGMQSKLEILPIVGMGGIAMKRSAPTQQVEISSDDSSSSEAENDDSRSQKPNDEPALELSAEAWLFRRAASYQEYMKSIPIPTNRGAVIPYTSWTGLGASMKQMY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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