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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000237`

染色体: Chr07 坐标: 1531159-1531499 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000237`
名称	SmilChr07G000237
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At3g22690-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1531159 - 1531499 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991437`
GeneID	`130991437`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991437`
原始查询	`SmilChr07G000237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pentatricopeptide repeat-containing protein At3g22690-like
产物	pentatricopeptide repeat-containing protein At3g22690-like
Arabidopsis	`AT3G22690` (AT3G22690) LOW protein: PPR containing-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821840] identity=64.8; qcov=1; evalue=2.8e-47; confidence=medium
Rice	`Os08g0249600` (OsSTA208) - identity=58.6; qcov=0.99; evalue=4.04e-44; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14432 (DYW_deaminase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991437

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057771651.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771651.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771651.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771651.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1531202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B2
`Chr7:1531206`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C63
`Chr7:1531206`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C63
`Chr7:1531213`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B86
`Chr7:1531213`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B86
`Chr7:1531238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B53,B65,C9
`Chr7:1531241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr7:1531251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B60,C70
`Chr7:1531298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B77,D10
`Chr7:1531304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C43,C52
`Chr7:1531316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C4,C53
`Chr7:1531365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771651.1

105 aa

105

DYW_deaminase

PF14432 DYW_deaminase 13-105 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771651.1`	Pfam	`PF14432`	DYW_deaminase	Domain	13	105	1.4e-40	137.7	DYW family of nucleic acid deaminases

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915668.1
TCCACAACACGTGCACAGCCTCGATGCTCGAAGAGATCGACTCGAGGCTCAGAGAAGCAGGGTATGCTCCGGATCTAACGAACGTCTTGCTCGATGTTGACGAGCAAGAGAAGGAGTTCTTGCTCGGTCGACACAGCGAGAAGCTCGCCATCGCTCACGGCCTCGTCTCCTCCGCCCGTGGAACACCGGTCAGAGTCATCAAGAATCTCCGAATGTGTTCCGACTGCCATTCCTTCGCAAAAATGGTCTCCAAAGTGTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991437
ATGCTCGAAGAGATCGACTCGAGGCTCAGAGAAGCAGGGTATGCTCCGGATCTAACGAACGTCTTGCTCGATGTTGACGAGCAAGAGAAGGAGTTCTTGCTCGGTCGACACAGCGAGAAGCTCGCCATCGCTCACGGCCTCGTCTCCTCCGCCCGTGGAACACCGGTCAGAGTCATCAAGAATCTCCGAATGTGTTCCGACTGCCATTCCTTCGCAAAAATGGTCTCCAAAGTGTATGATAGAGAGATAGTTGTTAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771651.1
MLEEIDSRLREAGYAPDLTNVLLDVDEQEKEFLLGRHSEKLAIAHGLVSSARGTPVRVIKNLRMCSDCHSFAKMVSKVYDREIVVRDNNRFHFFQQGLCSCRDYW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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