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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000242`

染色体: Chr07 坐标: 1567080-1569871 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000242`
名称	SmilChr07G000242
描述	proteasome subunit beta type-2-A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1567080 - 1569871 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991439`
GeneID	`130991439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991439`
原始查询	`SmilChr07G000242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proteasome subunit beta type-2-A-like
产物	proteasome subunit beta type-2-A-like
Arabidopsis	`AT3G22630` (PBD1) 20S proteasome beta subunit D1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821834] identity=81.7; qcov=0.99; evalue=2.19e-125; confidence=high
Rice	`Os03g0695600` (OsPBD1) - identity=75.5; qcov=1; evalue=9.27e-116; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0005839 (proteasome core complex); GO:0008233 (peptidase activity); GO:0010498 (proteasomal protein catabolic process); GO:0019774 (proteasome core complex, beta-subunit complex)
KEGG	smil03050 (Proteasome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00227 (Proteasome)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771654.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057771654.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771654.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771654.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771654.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1567396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr7:1568373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:1568477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr7:1569345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B25,C42,C71,D8
`Chr7:1569438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B54,C42
`Chr7:1569480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr7:1569507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C3,C77
`Chr7:1569516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B134,B95,C13,C52
`Chr7:1569552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C52
`Chr7:1569651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771654.1

204 aa

102

204

Proteasome

PF00227 Proteasome 3-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771654.1`	Pfam	`PF00227`	Proteasome	Domain	3	182	5.1e-44	150.9	Proteasome subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915671.1
TATGCTTTACCAAACACGCTTTTAGGCTTCTTGTTCTGCAAGACGCCTTCTCTATTCTAGCAAAGAACCATAAATAAACCAAAAAAAGCTCAAAACCCCCAAAACTGAGAATACATATTTCAGCCAAAAATCGAACTCAGATCCGAAGAAGAAACGCAGAAACCCACCGATTTCAGCTGCACAAAGGCAGATAAACACAGCAAAAATGGAGTCAGTTTTCGGGCTGGTCGGAAAGGATTTCGCGATAGTGGTGGCGGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991439
ATGGAGTCAGTTTTCGGGCTGGTCGGAAAGGATTTCGCGATAGTGGTGGCGGACACATCGGCGGTCCACAGCATTCTCGTGCACAAAACTAACGAGGACAAGATCATGGTCCTAGATTCTCACAAACTCATGGGCGCCTCCGGCGAGACCGGCGACCGGGCTCAGTTTACAGAGTATGTACAGAAGAATGTAGCTTTATACCAATTCCGTAATGGCATTCCTCTGACAACTGCAGCTACTGCAAACTTCACCAGAGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771654.1
MESVFGLVGKDFAIVVADTSAVHSILVHKTNEDKIMVLDSHKLMGASGETGDRAQFTEYVQKNVALYQFRNGIPLTTAATANFTRGELATALRKNPYMVNIILAGYDKDVGPSLYFIDYIASLHKVDKAAFGYGSYFALSLMDRHYRRDMTVEEAIELVDQCIREIRSRLVVAPPNFLIKIVDKDGAREFAWRESIKDAPVAAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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