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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000248`

染色体: Chr07 坐标: 1589062-1590921 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000248`
名称	SmilChr07G000248
描述	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 5-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1589062 - 1590921 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991446`
GeneID	`130991446`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991446`
原始查询	`SmilChr07G000248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 5-like
产物	non-specific lipid transfer protein GPI-anchored 5-like
Arabidopsis	`AT3G22600` (AT3G22600) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821832] identity=52.9; qcov=1.01; evalue=8.82e-47; confidence=medium
Rice	`Os07g0175600` (OsLTPG18) - identity=50.4; qcov=0.851; evalue=1.34e-34; confidence=medium
GO	GO:0006869 (lipid transport); GO:0008289 (lipid binding)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991446

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057771664.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771664.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771664.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771664.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1589278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C38,C60
`Chr7:1589324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D10
`Chr7:1589349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr7:1589433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:1589436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D10
`Chr7:1589450`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr7:1589450`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr7:1589526`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B89
`Chr7:1590586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B3,C19,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771664.1

168 aa

168

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 14-108 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 31-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771664.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	14	108	8.4e-19	68.2	Probable lipid transfer
`XP_057771664.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	31	108	4e-12	46.9	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915681.1
ATGAATATCTCAAACATAATCAACTATATATTATATCCCCACATTAGGAGAAAGTTGGTAAACCACCCCACCCCACCCCACCCCCACCCCCACCCCCAACCCCAACCCCTTATACCCCACCCTATATAAACCCCACAACCAAATCCAAACTCTCCATCACAAAAAAACAAAAACAAAACTACAAACTTTCTCATACAAAAACCTCAAGAAATGGCACACCAACACATCTCAATGGGCTTCGCCGTGACTCTTCTCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991446
ATGGCACACCAACACATCTCAATGGGCTTCGCCGTGACTCTTCTCGCCGCCGCCCTCTCCGCCGGCGTGGCGACGGCGCAATCGAGCGACTGCACAAACGTCCTCATCAGCATGTCGCCGTGCCTCAACTACATCTCCGGCAACTCCTCCTCCCCCTCCGCGGGGTGCTGCTCGCAGCTGCGCACGGTGGTGGGATCGCAGCCGGAGTGCCTCTGCGAGGTCCTCAACGGCGGCGGCTCCAACCTCGGCCTCAACATCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771664.1
MAHQHISMGFAVTLLAAALSAGVATAQSSDCTNVLISMSPCLNYISGNSSSPSAGCCSQLRTVVGSQPECLCEVLNGGGSNLGLNINQTQALALPAACTVQTPPLARCNAASPAGSPGSAPDSPNTNSGEGSKTVPNGDDGFSDASSNKLGVTALFCLLFVASYLNMA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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