当前解析结果
SmilChr07G000252| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000252 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000252 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G000252 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 1603949 - 1609362 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991449 |
|---|---|
| GeneID | 130991449 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991449 |
| 原始查询 | SmilChr07G000252 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991449 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057771668.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057771668.1 |
| 3 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.40000 | XP_057771670.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057771668.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771668.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:1604268 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A3,A9,B134,B5,B84,B86,B9,C36,C63,D9 |
Chr7:1604329 |
CCA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 41 | A8,B104,B107,B110,B112,B114,B119,B120,B125,B129,B130,B138,B16,B2,B29,B37,B47,B50,B67,B73,B79,B82,B91,B92,B98,C13,C17,C19,C25,C30,C34,C35,C39,C4,C43,C61,C7,C82,C85,D11,D8 |
Chr7:1604341 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B96 |
Chr7:1604358 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 41 | A22,A25,A3,A9,B101,B110,B111,B117,B124,B126,B129,B133,B16,B25,B27,B36,B45,B46,B48,B52,B65,B69,B72,B75,B83,B84,B86,B89,B9,C36,C47,C49,C54,C58,C69,C7,C71,C76,C78,D8,D9 |
Chr7:1604363 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr7:1604414 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C4,C53 |
Chr7:1604516 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B27,B59,B61,B90 |
Chr7:1604525 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A1,B83,C86 |
Chr7:1604527 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C33,C46 |
Chr7:1604534 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A15 |
Chr7:1608911 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B54,B96,C42 |
Chr7:1608948 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B137,C4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。