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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000258`

染色体: Chr07 坐标: 1664861-1665588 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000258`
名称	SmilChr07G000258
描述	uncharacterized SmilChr07G000258
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1664861 - 1665588 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991455`
GeneID	`130991455`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991455`
原始查询	`SmilChr07G000258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0665700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0665700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G22540` (AT3G22540) - identity=62.2; qcov=1.03; evalue=2.53e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0665700` - identity=60.9; qcov=1.06; evalue=2.14e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07911 (DUF1677)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991455

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771676.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771676.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771676.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771676.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1665210`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B3,B4,B54,C12,C15,C21,C42
`Chr7:1665247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B53
`Chr7:1665276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr7:1665284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B65
`Chr7:1665405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771676.1

108 aa

108

DUF1677

PF07911 DUF1677 3-90 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771676.1`	Pfam	`PF07911`	DUF1677	Family	3	90	2.6e-37	127.8	Protein of unknown function (DUF1677)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915693.1
GCCCAATGTCCCTTAGAACATGGAGAAAATTATGGCAGCTTTCCCTCCCTCCCTACTATAACTTCTCTCCTCTTCTCCAACTCCTCCTTCTTTCTAAATTCCAACATATTCCATAACAAAACCTCTCTCCCTCTCCTTCTCCCTCAAATCTAAAAAAATTAAAACCCCAAATCAAAAAAACAGAAGAAAAGTGAATTCACAACACAATACTACACACATGATCAAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGACATAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991455
ATGGACATAGAAGTGGTGAAGTGCGAGTGCTGCGGGCTGAAGGAGGAGTGCACAGAAGAGTATATAAAGGAGGTGAAGGGAAAGTTCGAAGGGAAATGGCTGTGCGGATTGTGCTCGGAGGCGGTGAGGGATGAGGTGAGCAGAGGGAAGAAGGAATCCGCCATGGATGAAGCTGTCAGAGCTCACATGACCTTCTGCCGCAAGTACAAATCCAACCCCGCCGTCCGCGTCGCCGACGGCATGCGCCAGATGCTGCGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771676.1
MDIEVVKCECCGLKEECTEEYIKEVKGKFEGKWLCGLCSEAVRDEVSRGKKESAMDEAVRAHMTFCRKYKSNPAVRVADGMRQMLRRRSAALPPTTSQVGDDSTFGYY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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