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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000270`

染色体: Chr07 坐标: 1745681-1748579 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000270`
名称	SmilChr07G000270
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1745681 - 1748579 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991462`
GeneID	`130991462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991462`
原始查询	`SmilChr07G000270`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G10920` (LOV1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837635] identity=32.3; qcov=0.586; evalue=2.9e-69; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=31.3; qcov=0.836; evalue=7.17e-78; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057771685.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771685.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771685.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771685.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771685.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1745739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,C27,D1,D10
`Chr7:1745804`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A10,A16,A2,A7,B101,B129,B18,B20,B22,B31,B37,B56,B6,B60,B69,B71,B73,B88,B89,C10,C15,C27,C38,C4,C48,C57,C6,C61,C7,C82,D1,D10,D6
`Chr7:1745837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B82,B97,D11
`Chr7:1745953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr7:1745978`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	95	A11,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A3,A5,A9,B1,B101,B103,B108,B118,B119,B120,B126,B127,B132,B133,B14,B140,B15,B16,B18,B25,B28,B31,B33,B34,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B53,B55,B59,B6,B64,B70,B74,B77,B81,B85,B9,B93,B94,B95,B98,C1,C10,C11,C16,C18,C2,C20,C21,C28,C3,C31,C35,C36,C38,C4,C41,C43,C48,C5,C50,C51,C53,C57,C6,C61,C63,C67,C69,C7,C73,C74,C76,C81,C85,C86,C9,D1,D3,D6,D9
`Chr7:1745980`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	81	A1,A13,A15,A23,A4,A6,A7,B1,B10,B104,B111,B12,B128,B131,B136,B139,B140,B15,B16,B21,B23,B27,B28,B29,B31,B35,B43,B5,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B60,B62,B69,B71,B72,B76,B78,B80,B82,B83,B87,B88,B90,B93,B94,B96,C10,C14,C15,C17,C18,C19,C27,C3,C33,C34,C36,C38,C4,C41,C43,C44,C45,C53,C54,C55,C63,C70,C72,C76,C78,C8,C80,C83,C86,D10,D5
`Chr7:1745990`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	131	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B101,B103,B104,B106,B107,B108,B115,B117,B118,B119,B120,B126,B127,B13,B132,B133,B136,B138,B139,B14,B15,B17,B18,B19,B20,B24,B25,B28,B29,B33,B34,B37,B38,B39,B41,B42,B44,B45,B46,B47,B55,B57,B6,B60,B62,B64,B66,B67,B69,B70,B72,B74,B77,B81,B83,B85,B86,B88,B9,B91,B93,B95,B98,B99,C1,C11,C16,C18,C2,C20,C21,C22,C27,C28,C31,C35,C38,C39,C41,C42,C43,C46,C48,C5,C50,C51,C53,C56,C57,C6,C60,C61,C63,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C76,C81,C83,C85,D10,D11,D3,D5,D6,D9
`Chr7:1746005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C7
`Chr7:1746068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B72,C1
`Chr7:1746087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C58
`Chr7:1746092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B14,B59,C61
`Chr7:1746123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771685.1

846 aa

423

846

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 138-307 aa PF23559 WHD_DRP 390-460 aa PF23598 LRR_14 509-730 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771685.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	138	307	1.3e-41	142.8	NB-ARC domain
`XP_057771685.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	390	460	1.4e-21	77.0	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057771685.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	509	730	1.8e-17	63.9	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915702.1
TTTCCTTTCCTTTTGTTTATTTTTGGAGTGAGAAGAGATCTGAAATATGGCTTACAATCTTCAATCTCTCATCACCATCCTCCAAGGGATTCTGGATCCCCAACAAACACGCTGGATTCTTGGATCTGATGAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCCAAAAAGCTTCTTCCCTGCAGCAGATTCTCGAAAAATCTCCACCACTCACCAAAATACCAAGCTTGGAGTGCCAAATCAGAGACGTAGCAAATGAAGCAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991462
ATGGCTTACAATCTTCAATCTCTCATCACCATCCTCCAAGGGATTCTGGATCCCCAACAAACACGCTGGATTCTTGGATCTGATGAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCCAAAAAGCTTCTTCCCTGCAGCAGATTCTCGAAAAATCTCCACCACTCACCAAAATACCAAGCTTGGAGTGCCAAATCAGAGACGTAGCAAATGAAGCAGAAGACATCGTTGAATCTCACATGGTTGAACGACTGCTCTCGATGCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771685.1
MAYNLQSLITILQGILDPQQTRWILGSDEKPQLQSLLQKASSLQQILEKSPPLTKIPSLECQIRDVANEAEDIVESHMVERLLSMPESVTPDVLLVTQKLDSLTQQVAELVEVERNKKPTGSSWSGASFSSVVVGVDEDLMQLKDRLIGMQSKLEILPIVGMGGIGKTTLARTLYQDPLILHHFSYLAWTTISQDYNMRSILLSLLRCITGSDYEHEGDGELKDILYRSLCGRRYMIVLDDIWSTTFWDEIRRYFPDNNK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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