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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000272`

染色体: Chr07 坐标: 1751673-1753503 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000272`
名称	SmilChr07G000272
描述	late blight resistance protein R1-A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1751673 - 1753503 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991464`
GeneID	`130991464`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991464`
原始查询	`SmilChr07G000272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late blight resistance protein R1-A-like
产物	late blight resistance protein R1-A-like
Arabidopsis	`AT3G07040` (RPM1) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819889] identity=30.7; qcov=0.602; evalue=2.88e-19; confidence=low
Rice	`Os12g0500500` - identity=33.9; qcov=0.619; evalue=2.31e-25; confidence=low
GO	GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991464

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057771687.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057771687.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057771687.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057771687.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771687.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1751971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:1751974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B93,C53
`Chr7:1751975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B78,C60,D9
`Chr7:1751997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,C34,C70,D3
`Chr7:1751999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,C25,C64
`Chr7:1752001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B93,C53,C60,D9
`Chr7:1752009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C25,C64
`Chr7:1752017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:1752039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:1752069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C53
`Chr7:1752095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr7:1752104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771687.1

362 aa

181

362

WHD_DRP

LRR_14

PF23559 WHD_DRP 4-74 aa PF23598 LRR_14 124-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771687.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	4	74	4.5e-21	75.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057771687.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	124	342	2.5e-12	47.0	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915704.1
TCAAAGTTGGGATCTTCTTAGCCAAATTGTGTTTGGAGAAGAGGATTGCCCTCATGAGTTACAAGGGATAGGGAAGAAGATTTCGAGTGATTGCGGTGGGCTTCCTCTGGCTATCAATGTGATTGGAGGGCTGTTGTCAAAGGTGGAAAGATTGAAAGATGTTTGGGAGAATATTGGGAACGACGTAAGAGCTGCAATTGCTGAATCAGACAAGCAGTTCTCCAATATACTATCAGGCCTTAAGTTATAACCATTTGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991464
ATGGCAGCATTCCCCGAAGATTATGAGATGAAGGCCTCAGGGCTCATAAGGATGTGGGTAGCAGAAGGATTTGTGAAATCGAATGGGGATAAAAGTTTGGAAGATGAGGCAGAGGATTATTTAAAGTCCCTTGTAGAAAGGAATGTAGTTTCGGTTAGACTTTGTAATTGGTATGGAAAAGCAAAGAGGTACAACATGCATGATCTTTTGAGAGATTTATGCATTGGGAAAGCTGATGATGAGAAGTTTCTACATCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771687.1
MAAFPEDYEMKASGLIRMWVAEGFVKSNGDKSLEDEAEDYLKSLVERNVVSVRLCNWYGKAKRYNMHDLLRDLCIGKADDEKFLHLKNSPKVRFSNQLRRVSIHTSYVLEDIDEYASSSEMSLVRSFLLVIKLDRNLSPIVFTLSLLRVLDLLEMCKIKFPEEILQLVNLCYLSINCKSLPRSGISRLCNLQTLIARLSFYSYCPVELWEMYELRHLIMLGVYLRIEDDYMKKIVLKKMQTIRGMKLNPSVIRMGFLESI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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