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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000274`

染色体: Chr07 坐标: 1779202-1782438 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000274`
名称	SmilChr07G000274
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1779202 - 1782438 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991461`
GeneID	`130991461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991461`
原始查询	`SmilChr07G000274`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT1G53350` (AT1G53350) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841771] identity=28.1; qcov=0.995; evalue=1.64e-75; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=30.8; qcov=0.943; evalue=8.97e-79; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057771684.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057771684.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771684.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771684.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771684.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1779261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C33,C39
`Chr7:1779263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C39
`Chr7:1779371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr7:1779437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,C27,C29,C61
`Chr7:1779441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B68,C16,C18,C39
`Chr7:1779477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr7:1779493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C38
`Chr7:1779497`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	74	A16,A18,A7,A8,B110,B111,B114,B117,B12,B125,B126,B129,B131,B132,B138,B16,B17,B18,B20,B24,B27,B28,B31,B35,B38,B39,B48,B50,B51,B54,B57,B6,B67,B69,B74,B79,B8,B81,B83,B85,B86,B93,B94,B97,C11,C14,C17,C19,C22,C25,C26,C27,C3,C32,C39,C4,C43,C45,C46,C56,C58,C60,C62,C65,C67,C7,C72,C73,C76,C82,C86,D6,D7,D8
`Chr7:1779510`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	95	A10,A13,A16,A18,A19,A6,A7,A8,B104,B11,B110,B111,B114,B117,B12,B123,B125,B126,B129,B130,B131,B132,B138,B139,B16,B17,B18,B20,B23,B24,B27,B28,B29,B31,B35,B38,B39,B48,B50,B51,B52,B54,B57,B6,B60,B67,B69,B74,B79,B8,B81,B83,B84,B85,B86,B93,B94,B97,C11,C14,C17,C19,C22,C25,C26,C27,C3,C32,C38,C39,C4,C41,C43,C45,C46,C51,C56,C58,C60,C62,C64,C65,C67,C7,C72,C73,C76,C79,C82,C86,C87,D11,D6,D7,D8
`Chr7:1779515`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	14	A16,A20,B15,B33,B53,B58,C18,C2,C34,C36,C6,C77,D1,D10
`Chr7:1779537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B35,B81
`Chr7:1779591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C37,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771684.1

858 aa

429

858

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 146-315 aa PF23559 WHD_DRP 398-471 aa PF23598 LRR_14 520-749 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771684.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	146	315	5.8e-44	150.4	NB-ARC domain
`XP_057771684.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	398	471	4.8e-20	72.1	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057771684.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	520	749	2.2e-13	50.4	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915701.1
TTTTGTTTTGTTTATTTTTCGAGTGAGAAGAGATCAGAAAAATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAAACCTCAACAATCGCGCTGGATTGTTGATCACAACAAACCGCAACTCGAATCCCTCCTCGAAAAAGCTTCTTACCTGCAGCTGCAGATTCTCCAAAAAACTCCACTACTCACCAAATTACCAAGCTTGGAGTTCCAAATCAGAGACGTAGCAAATGAAGCAGAAGATATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991461
ATGGCTTACAATCTTCAACCCCTCATCACCATCCTACAACAAATCTTGAAACCTCAACAATCGCGCTGGATTGTTGATCACAACAAACCGCAACTCGAATCCCTCCTCGAAAAAGCTTCTTACCTGCAGCTGCAGATTCTCCAAAAAACTCCACTACTCACCAAATTACCAAGCTTGGAGTTCCAAATCAGAGACGTAGCAAATGAAGCAGAAGATATCGTTGAATCTCACATGGTTGAACGAATGCTCTCGATGCCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771684.1
MAYNLQPLITILQQILKPQQSRWIVDHNKPQLESLLEKASYLQLQILQKTPLLTKLPSLEFQIRDVANEAEDIVESHMVERMLSMPEGVNITPLTPDVLLVTQKLDSLTQQVAKLVEVERNKKPTGSSWSGASFSSSKSVLVGVDEDLKQLQDRLIGMQSKLEILPIVGMGGIGKTTLARKLYQDPLIVDHFSYLAWTTISQDYNMRSILLSLLRCITGSEYEHEGDGELKDNLYRSLCGRRYMIVLDDIWSTTFWDEIR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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