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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000276`

染色体: Chr07 坐标: 1790182-1791948 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000276`
名称	SmilChr07G000276
描述	late embryogenesis abundant protein D-34-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1790182 - 1791948 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991469`
GeneID	`130991469`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991469`
原始查询	`SmilChr07G000276`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein D-34-like
产物	late embryogenesis abundant protein D-34-like
Arabidopsis	`AT3G22490` (AT3G22490) Seed maturation protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821820] identity=56.1; qcov=1; evalue=1.16e-70; confidence=high
Rice	`Os03g0159600` (OsLEA30) - identity=51.1; qcov=1.07; evalue=1.41e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04927 (SMP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991469

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771695.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771695.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057771696.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057771695.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057771696.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1790452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B35
`Chr7:1791520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,B78,B81
`Chr7:1791559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B8,B88,C8
`Chr7:1791700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:1791711`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A10,A5,A6,B10,B114,B125,B127,B129,B136,B139,B18,B21,B31,B45,B59,B6,B69,B71,B90,B91,B95,B97,C23,C39,C45,C55,C59,C7,C70,C81,D1,D8
`Chr7:1791722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B81
`Chr7:1791806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B17,C30,C36,C6
`Chr7:1791808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B51,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771695.1

262 aa

131

262

SMP

PF04927 SMP 19-74 aa PF04927 SMP 134-190 aa PF04927 SMP 199-257 aa

XP_057771696.1

213 aa

106

213

SMP

PF04927 SMP 19-74 aa PF04927 SMP 134-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771695.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	19	74	9.7e-56	186.7	Seed maturation protein
`XP_057771695.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	134	190	9.7e-56	186.7	Seed maturation protein
`XP_057771695.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	199	257	9.7e-56	186.7	Seed maturation protein
`XP_057771696.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	19	74	1.8e-37	128.2	Seed maturation protein
`XP_057771696.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	134	190	1.8e-37	128.2	Seed maturation protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915712.1
CATCGAACCCACGCTGTCCTAAAAATCACCCGCCACATGTCTTCATAATCCGGCCAACACCACACTTCCTTTCCAATCACAACACTATTTAAACAGCAATTTTTTGAGCTGCTGAATTGGGAAAAAGCATATTGTGAGAGCAAAATTAAGGATCAGGATGAGCCAAGAACAACCGGAGAGGCCACAGGCGGCGGAGCAGCCACAGCAGCCCATCAAGTACGGCGACGTCTTCGACGTTTCCGGCGACCTCGCCGACCAGC...

XM_057915713.1
TCGAACCCACGCTGTCCTAAAAATCACCCGCCACATGTCTTCATAATCCGGCCAACACCACACTTCCTTTCCAATCACAACACTATTTAAACAGCAATTTTTTGAGCTGCTGAATTGGGAAAAAGCATATTGTGAGAGCAAAATTAAGGATCAGGATGAGCCAAGAACAACCGGAGAGGCCACAGGCGGCGGAGCAGCCACAGCAGCCCATCAAGTACGGCGACGTCTTCGACGTTTCCGGCGACCTCGCCGACCAGCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130991469
ATGAGCCAAGAACAACCGGAGAGGCCACAGGCGGCGGAGCAGCCACAGCAGCCCATCAAGTACGGCGACGTCTTCGACGTTTCCGGCGACCTCGCCGACCAGCCCGTGGCGCCGCAAGATGCGGCCTTGATGCAGGCCGCCGAGACCGCCGTGTTGGGGCAGACGCAGAAAGCTGGCCCCGCCGCCGCCATGCAAGCGGCCGCCACCATCAATGAGAGGGCCGGCCTCGTCGGCCACGACGACGCCACCGAAGCCGCCCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057771695.1
MSQEQPERPQAAEQPQQPIKYGDVFDVSGDLADQPVAPQDAALMQAAETAVLGQTQKAGPAAAMQAAATINERAGLVGHDDATEAAREGGVTVAETEFQGTRLVTESVAGQVVGQYYEATSVLSATGAAPQAMVTIGEALEAAGRAAGNKPVDHGDAAAIQAAECRATGSSLVAPGGLAAAAQSAAAYNDGFAGNEGRVKLADILSDAAAKLPADKVATREDAEGIMSAELRNDPHRKTHAGGVAEAVAAAATVNEEGDA...

XP_057771696.1
MSQEQPERPQAAEQPQQPIKYGDVFDVSGDLADQPVAPQDAALMQAAETAVLGQTQKAGPAAAMQAAATINERAGLVGHDDATEAAREGGVTVAETEFQGTRLVTESVAGQVVGQYYEATSVLSATGAAPQAMVTIGEALEAAGRAAGNKPVDHGDAAAIQAAECRATGSSLVAPGGLAAAAQSAAAYNDGFAGNEGRVKLADILSNCRCTIC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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