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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000280`

染色体: Chr07 坐标: 1814316-1817250 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000280`
名称	SmilChr07G000280
描述	tRNA-specific adenosine deaminase TAD3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1814316 - 1817250 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991476`
GeneID	`130991476`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991476`
原始查询	`SmilChr07G000280`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA-specific adenosine deaminase TAD3
产物	tRNA-specific adenosine deaminase TAD3
Arabidopsis	`AT5G24670` (EMB2820) Cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832539] identity=53.7; qcov=0.993; evalue=1.94e-140; confidence=high
Rice	`Os09g0128600` (P0448B11.8-1) - identity=44.3; qcov=0.988; evalue=1.23e-115; confidence=medium
GO	GO:0002100 (tRNA wobble adenosine to inosine editing); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0052717 (tRNA-specific adenosine-34 deaminase activity)
KEGG	-
Pfam	PF30953 (TAD3_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991476

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771713.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057771713.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771713.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771713.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771713.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1814398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B46,C41,D11
`Chr7:1814435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:1815118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:1815129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B67
`Chr7:1815158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr7:1815161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:1815191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr7:1815649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A24,B35,B81,C35
`Chr7:1815669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:1815674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:1816116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B71,B78,D2
`Chr7:1816174`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771713.1

409 aa

204

409

TAD3_N

PF30953 TAD3_N 35-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771713.1`	Pfam	`PF30953`	TAD3_N	Domain	35	136	1.3e-42	144.7	tRNA-specific adenosine deaminase TAD3 N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915730.1
AGTATCAGACTACAAGTTGCCATCTCGAGCAAAGATGAAGGGCAGCGCTGATGGAGAAACTGCAGGCCCATCACAATGTTGGGAAATCGTTCACATTCCTGGAAAACCTCCGATTTCTCCTGAGCTCCAGCCTACAGTGGATGTACTTGCTTCTGCAATTGATGCTAAGCATGCAAATACTATAGTCAGAAAACTAAATCATATAGCACCCTTGGAAGGCCTCCGCCATGTGAAGCGCGTAAAAAAGACTGTTGTTGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991476
ATGAAGGGCAGCGCTGATGGAGAAACTGCAGGCCCATCACAATGTTGGGAAATCGTTCACATTCCTGGAAAACCTCCGATTTCTCCTGAGCTCCAGCCTACAGTGGATGTACTTGCTTCTGCAATTGATGCTAAGCATGCAAATACTATAGTCAGAAAACTAAATCATATAGCACCCTTGGAAGGCCTCCGCCATGTGAAGCGCGTAAAAAAGACTGTTGTTGATGGTGGAAAGAGTCAATTATTTGTGATTATATGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771713.1
MKGSADGETAGPSQCWEIVHIPGKPPISPELQPTVDVLASAIDAKHANTIVRKLNHIAPLEGLRHVKRVKKTVVDGGKSQLFVIICMDSGSNAESNYMPEDVQGLMNTYQLSTFTTKVCKYAATTKEEWEEQCKLWPTSFHPPTFNIDGITGFTEEDSLSVLNFMKHAVRMAKSGASLVNAAVIVDPLSGEIIASSCDEVLYPGAPTKGSSKESCCSKYRETTIQGDANEMEKSLISNEAKQSYMEVSCLHPWGWLEQRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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