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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000281`

染色体: Chr07 坐标: 1817402-1819788 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000281`
名称	SmilChr07G000281
描述	photosystem II D1 precursor processing protein PSB27-H2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1817402 - 1819788 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991477`
GeneID	`130991477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991477`
原始查询	`SmilChr07G000281`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem II D1 precursor processing protein PSB27-H2, chloroplastic
产物	photosystem II D1 precursor processing protein PSB27-H2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G05385` (LPA19) photosystem II 11 kDa protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837040] identity=74.1; qcov=0.668; evalue=1.01e-66; confidence=high
Rice	`Os03g0747700` - identity=74.2; qcov=0.594; evalue=1.21e-56; confidence=medium
GO	GO:0009523 (photosystem II); GO:0009543 (chloroplast thylakoid lumen); GO:0010206 (photosystem II repair); GO:0010207 (photosystem II assembly)
KEGG	-
Pfam	PF13326 (PSII_Pbs27)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771714.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057771714.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057771714.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771714.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771714.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1817988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B35,B61,B89,C12
`Chr7:1818261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B120,B34,B54,C35
`Chr7:1818402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B42,B43,B62
`Chr7:1818422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B65,C22,C47
`Chr7:1818635`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771714.1

202 aa

101

202

PSII_Pbs27

PF13326 PSII_Pbs27 41-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771714.1`	Pfam	`PF13326`	PSII_Pbs27	Family	41	201	1.5e-46	158.9	Photosystem II Pbs27

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915731.1
TTTCTTTGAAAATTATGATTAAATTGATAATTTTAAAACAAATTAGCATTTTTTATGAAAAAAAAAAAAGAACCCATAAGGTTTTGCCTTATTTTACTGTTAGGCTTGAAATTTTTGTCACAAAAATACTGATGTAATTTTATTAATCATTAAACATAAATATATTGTAGTTGACTATTTTGCCCCCAAATTTTATCAAATTCCTTTCCCATCCTCAACGGATAAAATGAGAATCAGTTATCAGTTGAAGACTGGTTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991477
ATGGCAGCTTTTACTGCAGCGAGGATTTGCTCCCTCGCCATTTCTAGTTCCGCCGACAGAAGCAACAAGAGACTACAATCAAGGTGTAATGCTGTGCTTTCCTTTGATGAAACATCAACAAGTCGTCGGTTTCTTATGCAAAGTGCTGCTGTTTCTGCACTTGTATTGCTAAATTTGAACGGTGGATTGATGTCATTGCCTGCACGGGCCGAGGAGAAGGCGAAGGAAGAAGGCGAGGGTCTAGTTGGGGCATTGCAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771714.1
MAAFTAARICSLAISSSADRSNKRLQSRCNAVLSFDETSTSRRFLMQSAAVSALVLLNLNGGLMSLPARAEEKAKEEGEGLVGALQSLFDPNEKTKSGKVLPKAYLKSAREVVKTLRESLEEDTKDMAKFRRTADAAKESIREYLSGWRGQKEVVNEESYAMLEKAIRSLASFYSKAGPSAPLPKEVKTEILSDLTTAEDSF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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