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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000287`

染色体: Chr07 坐标: 1855818-1857128 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000287`
名称	SmilChr07G000287
描述	uncharacterized SmilChr07G000287
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1855818 - 1857128 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993027`
GeneID	`130993027`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993027`
原始查询	`SmilChr07G000287`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Survival protein SurE-like phosphatase/nucleotidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827151]; symbol=AT4G14930; hit=AT4G14930; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Survival protein SurE-like phosphatase/nucleotidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827151]; symbol=AT4G14930; hit=AT4G14930; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G14930` (AT4G14930) Survival protein SurE-like phosphatase/nucleotidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827151] identity=48; qcov=1; evalue=3.58e-72; confidence=high
Rice	`Os07g0204500` - identity=41.5; qcov=0.978; evalue=6.86e-51; confidence=medium
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0008252 (nucleotidase activity)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00760 (Nicotinate and nicotinamide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01975 (SurE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993027

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773731.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057773731.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773731.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773731.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773731.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1856238`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	57	A10,A2,A4,A5,B107,B108,B111,B113,B117,B125,B13,B139,B24,B29,B33,B38,B39,B40,B42,B43,B46,B49,B53,B59,B65,B66,B7,B72,B76,B79,B85,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B98,C16,C2,C21,C23,C30,C33,C40,C44,C5,C58,C62,C73,C77,C78,C82,C85,C86,D4,D6
`Chr7:1856250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:1856303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A25,B11,B110,B123,B135,B136,B17,B18,B23,B25,B36,B45,B6,B64,B67,B83,C16,C22,C48,C54,C67,C72
`Chr7:1856341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:1856591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B134,B75,B80,B89,C51,C72
`Chr7:1856604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:1856612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:1856618`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	97	A10,A11,A2,A21,A23,A24,A3,A5,A6,B102,B103,B104,B107,B108,B109,B115,B117,B12,B124,B13,B132,B133,B134,B139,B140,B17,B18,B21,B24,B29,B30,B32,B35,B38,B39,B4,B42,B43,B44,B47,B52,B54,B57,B59,B62,B65,B66,B68,B7,B72,B75,B76,B8,B80,B82,B85,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B99,C12,C15,C2,C21,C25,C27,C3,C30,C32,C33,C40,C45,C46,C49,C5,C51,C52,C58,C62,C68,C72,C73,C77,C78,C8,C82,C83,C85,C86,C9,D11,D7
`Chr7:1856640`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr7:1856640`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr7:1856642`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B37,B91
`Chr7:1856693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773731.1

224 aa

112

224

SurE

PF01975 SurE 2-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773731.1`	Pfam	`PF01975`	SurE	Domain	2	117	3.3e-21	76.6	Survival protein SurE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917748.1
ATGGGAATTTCCAAGTCTCTCTTCACCTCTATACCTGATCTGGTAATCAGTGGCATTAACAAGAGCAGAAACTGTGGTTATCACATTATTTATTCAGGGTATGTAGCAGGCGCCCGCGAAGCATTTCTGCACAACGTACCTGCTGTTTCTATATCGTATGACTGGTACGGTCCAGGAGGGAGGCGCAACGTTGACGAGTTTGCACTTGCAGCAGAGGCTTGCTTGCCTATAATCAGCGGTATGTTGGATGAGATCAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993027
ATGGGAATTTCCAAGTCTCTCTTCACCTCTATACCTGATCTGGTAATCAGTGGCATTAACAAGAGCAGAAACTGTGGTTATCACATTATTTATTCAGGGTATGTAGCAGGCGCCCGCGAAGCATTTCTGCACAACGTACCTGCTGTTTCTATATCGTATGACTGGTACGGTCCAGGAGGGAGGCGCAACGTTGACGAGTTTGCACTTGCAGCAGAGGCTTGCTTGCCTATAATCAGCGGTATGTTGGATGAGATCAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773731.1
MGISKSLFTSIPDLVISGINKSRNCGYHIIYSGYVAGAREAFLHNVPAVSISYDWYGPGGRRNVDEFALAAEACLPIISGMLDEIKKNTYPRNSFLNINVPADVVNHKGYWPTKPGNSMNKTGWRQVASQAQGEEMISAMVAAARSSSISEPEATDATKNEHLLFIRKLLAFQVEDGGTDYSSLLEGYISVSPLAAMSPAEEESHSYFAEWLPLLNQCFSSSTI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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