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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000291`

染色体: Chr07 坐标: 1883917-1884622 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000291`
名称	SmilChr07G000291
描述	probable cysteine protease RD19B
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1883917 - 1884622 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993028`
GeneID	`130993028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993028`
原始查询	`SmilChr07G000291`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable cysteine protease RD19B
产物	probable cysteine protease RD19B
Arabidopsis	`AT2G21430` (AT2G21430) Papain family cysteine protease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816682] identity=26.9; qcov=0.89; evalue=3.23e-09; confidence=low
Rice	`Os02g0469600` - identity=25.5; qcov=0.89; evalue=1.1e-07; confidence=low
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00112 (Peptidase_C1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057773732.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057773732.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773732.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773732.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1883950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,C28,C29
`Chr7:1883952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C78
`Chr7:1884099`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A25,B11,B110,B17,B36,B53,B6,B83,B84,C14,C22,C67,C72,C81
`Chr7:1884143`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C58,C78
`Chr7:1884143`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C58,C78
`Chr7:1884147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B131,B140,B4,C15
`Chr7:1884157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,C17,C21,D6
`Chr7:1884170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B109,B23,B30,B32,C74,C87
`Chr7:1884177`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	21	A15,A22,B109,B23,B30,B32,B35,B5,B58,B87,C36,C39,C44,C48,C57,C6,C64,C66,C74,C87,D11
`Chr7:1884180`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A14,A21,B102,B11,B125,B17,B36,B38,B39,B53,B6,B83,C12,C22,C24,C27,C31,C67,C72,C81,C87
`Chr7:1884183`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	38	A11,A5,A7,B1,B10,B103,B108,B117,B133,B16,B21,B24,B33,B34,B37,B42,B43,B59,B6,B60,B64,B83,B89,B9,B99,C11,C17,C19,C23,C30,C40,C41,C59,C67,C69,D1,D10,D6
`Chr7:1884258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B129,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773732.1

163 aa

163

Peptidase_C1

PF00112 Peptidase_C1 26-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773732.1`	Pfam	`PF00112`	Peptidase_C1	Domain	26	152	3.1e-08	34.7	Papain family cysteine protease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057917749.1
ATGGATTTATACAACGATCCATTTTTTACATATGCGGATTATTGTTGGCCGGTAGTCTACCGCGACTGTGACTTCCCAGTGAGACGTCAGCGGCAAACACGTACTTGCTATGCCTTTTCTACTGTGGATGCCATTTCCGCGTCGTATTACATGGCTACCGGCCAGAATTTCAGATGCTCGGAACAAGAGTGCTTGGATTTTTTTATTTCAGACGCCTTCGACTATGTGAAGCAGTTTGGGCTGTCACGAGATTCGGACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993028
ATGGATTTATACAACGATCCATTTTTTACATATGCGGATTATTGTTGGCCGGTAGTCTACCGCGACTGTGACTTCCCAGTGAGACGTCAGCGGCAAACACGTACTTGCTATGCCTTTTCTACTGTGGATGCCATTTCCGCGTCGTATTACATGGCTACCGGCCAGAATTTCAGATGCTCGGAACAAGAGTGCTTGGATTTTTTTATTTCAGACGCCTTCGACTATGTGAAGCAGTTTGGGCTGTCACGAGATTCGGACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057773732.1
MDLYNDPFFTYADYCWPVVYRDCDFPVRRQRQTRTCYAFSTVDAISASYYMATGQNFRCSEQECLDFFISDAFDYVKQFGLSRDSDYPFLGQWQNVPWTDRLKTVPIGPRIYITDYMRLGGDRKVGRVLEIDHETIRRNLRMMGPLVVGLPVVAEPKIYIAEG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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