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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000293`

染色体: Chr07 坐标: 1896403-1900678 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000293`
名称	SmilChr07G000293
描述	uncharacterized SmilChr07G000293
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1896403 - 1900678 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991485`
GeneID	`130991485`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991485`
原始查询	`SmilChr07G000293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827031]; symbol=AT4G13965; hit=AT4G13965; species=arabidopsis; confidence=low
产物	F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827031]; symbol=AT4G13965; hit=AT4G13965; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G13965` (AT4G13965) F-box/FBD/LRR protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827031] identity=25.9; qcov=0.844; evalue=3.47e-07; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991485

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771723.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771723.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771723.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771723.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057771723.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1896869`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B3,B50,C19
`Chr7:1897184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C28,C29
`Chr7:1897209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr7:1897215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,C12,C27,C8
`Chr7:1897229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B30,B68,B70,C4
`Chr7:1897464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,C12,C27
`Chr7:1897591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B129,B37
`Chr7:1897652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr7:1897653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C24
`Chr7:1897662`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B47
`Chr7:1897684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D6
`Chr7:1898182`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A4,B103,B113,B132,B135,B42,B43,B62,B64,B89,B99,C23,C3,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771723.1

417 aa

208

417

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 145-350 aa

XP_057771724.1

417 aa

208

417

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 145-350 aa

XP_057771725.1

417 aa

208

417

LRR_At1g61320_AtMIF1

PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 145-350 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771723.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	145	350	8.6e-10	39.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057771724.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	145	350	8.6e-10	39.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057771725.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	145	350	8.6e-10	39.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915740.1
ATATTACAAGTGGTAAAACTAAACCCTATTCTCAATTTCTCATCCTCATTTTGAAACTCCCAAGTGAGTCCCAGCGGCGCCTCCCTTTCCTCCCTCCCTCCCAGCCGAAACCCTAGTTTCCTCCTTCCCTCCCAGCCGCGCGGCGCCTCCTCCACACTTCCCAGCCGGCAGCCGGCGCCTCTCTAACCAGCGACCACCCCCAGCGCCTCCATTCTCTGCACGACTGGCAGACCAGGACGGCAGCGCAGCACGAGCAGACC...

XM_057915742.1
ACTAAACCCTATTCTCAATTTCTCATCCTCATTTTGAAACTCCCAAGTGAGTCCCAGCGGCGCCTCCCTTTCCTCCCTCCCTCCCAGCCGAAACCCTAGTTTCCTCCTTCCCTCCCAGCCGCGCGGCGCCTCCTCCACACTTCCCAGCCGGCAGCCGGCGCCTCTCTAACCAGCGACCACCCCCAGCGCCTCCATTCTCTGCACGACTGGCAGACCAGGACGGCAGCGCAGCACGAGCAGACCCGCCGGCCGCCCCCCGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130991485
ATGGATGTAATGGCTGTAATGGATGGAAGCGACTCAAAGCGGCCCTGCAGAAAACAAAAGCGTAAACGGAAACAGGTTGACGACAGGATAAGTAAGCTGTCTGAAGACATAATCCTTAAGATGTCGGATTTGTGGAAAGACACCTCTAAACTCGATTTTCAAAACACCGATTGCACTTTCAAAACTGAAATTGAGCACACTTCATGGGATGCGGAGAACTGCAAGTATGTGAAAATGGTAAATTCGGCTATCGAATCGCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771723.1
MDVMAVMDGSDSKRPCRKQKRKRKQVDDRISKLSEDIILKMSDLWKDTSKLDFQNTDCTFKTEIEHTSWDAENCKYVKMVNSAIESHQSPCLQSFILQFYVNKSGKSAVAKWLEFAWSRRVECLMFNFQCRRPESMLVLEELLAEMRPMNYLKRLCLTGMRVGGEAISLILRNCPMLLDLNIRVRADLTSDVHVCGGAALKLNRLRISYYCPESTKSVYISAPNLTMVNLTATKRGKLFFENVPKLVHAVFTVGYARYIG...

XP_057771724.1
MDVMAVMDGSDSKRPCRKQKRKRKQVDDRISKLSEDIILKMSDLWKDTSKLDFQNTDCTFKTEIEHTSWDAENCKYVKMVNSAIESHQSPCLQSFILQFYVNKSGKSAVAKWLEFAWSRRVECLMFNFQCRRPESMLVLEELLAEMRPMNYLKRLCLTGMRVGGEAISLILRNCPMLLDLNIRVRADLTSDVHVCGGAALKLNRLRISYYCPESTKSVYISAPNLTMVNLTATKRGKLFFENVPKLVHAVFTVGYARYIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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