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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000302`

染色体: Chr07 坐标: 1988558-1989637 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000302`
名称	SmilChr07G000302
描述	primary amine oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1988558 - 1989637 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991495`
GeneID	`130991495`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991495`
原始查询	`SmilChr07G000302`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	primary amine oxidase-like
产物	primary amine oxidase-like
Arabidopsis	`AT4G14940` (AO1) amine oxidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827152] identity=42; qcov=0.794; evalue=2.44e-23; confidence=medium
Rice	`Os07g0572050` - identity=54.5; qcov=0.755; evalue=4.23e-25; confidence=medium
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0008131 (primary methylamine oxidase activity); GO:0009308 (amine metabolic process); GO:0048038 (quinone binding)
KEGG	-
Pfam	PF02728 (Cu_amine_oxidN3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991495

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057771733.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771733.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771733.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771733.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771733.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1989223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr7:1989311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,B97
`Chr7:1989346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr7:1989349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:1989442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C19
`Chr7:1989447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771733.1

102 aa

102

Cu_amine_oxidN3

PF02728 Cu_amine_oxidN3 1-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771733.1`	Pfam	`PF02728`	Cu_amine_oxidN3	Domain	1	75	9.1e-17	61.9	Copper amine oxidase, N3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915750.1
AGATCATTTATAATGAGCCAACTCAAAATAAAATATGTCACTTTCAGTGGTATCAGATGGATTACTTTTTATAAGCCATCACTCACTACTTGAAAATGAACCATAACAAAAGAAAAATATTTGTACTTGGAAATCATACCAAAAAAATGCTTCCATCAATAAAAAATCCTATCTTCTTCTTCTTCATCTTCGTCATCATCTTTCTTCCGAGCTCCAATCGCCATCTCACTCCAAGATTCTCCTCACCCCTTAGACTCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991495
ATGGAGGAGGTGGTGTGCATGAGCTTCACCGTGGGGTGGTTCGGACAGGAGCGGAGCCGGAGGATGGTTAGGGTTATGTGTTACTATATGGATGGGACGGTTAATATCTACATGAGGCCTATCGAGGGCGTCACCGTGGCCGTCGATCTCGATCGGAGGGCGATCATCGGGTTCCACGACCGGGTCGTGGTCCCGGTGCCGAAAGCTCAAGGCACGGATTACACCGGTCGTGATCAGCCGTACATGGAGAGTGAAGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771733.1
MEEVVCMSFTVGWFGQERSRRMVRVMCYYMDGTVNIYMRPIEGVTVAVDLDRRAIIGFHDRVVVPVPKAQGTDYTGRDQPYMESEGGVDEDASFTLDGNVLR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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