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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000304`

染色体: Chr07 坐标: 1998911-2002862 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000304`
名称	SmilChr07G000304
描述	primary amine oxidase 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	1998911 - 2002862 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991498`
GeneID	`130991498`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991498`
原始查询	`SmilChr07G000304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	primary amine oxidase 1-like
产物	primary amine oxidase 1-like
Arabidopsis	`AT4G14940` (AO1) amine oxidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827152] identity=54.8; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0338200` (OsDAO1) - identity=46; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0008131 (primary methylamine oxidase activity); GO:0009308 (amine metabolic process); GO:0048038 (quinone binding)
KEGG	smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00350 (Tyrosine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00360 (Phenylalanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00950 (Isoquinoline alkaloid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00960 (Tropane, piperidine and pyridine alkaloid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01179 (Cu_amine_oxid); PF02727 (Cu_amine_oxidN2); PF02728 (Cu_amine_oxidN3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991498

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057771735.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057771735.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057771735.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771735.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771735.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:1999130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B63,C71,C76
`Chr7:1999272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B63,C71,C76
`Chr7:1999275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B101,B63,C71,C76
`Chr7:1999278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr7:1999330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B94
`Chr7:1999350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr7:1999384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr7:1999422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr7:1999535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr7:1999656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B13,C26,C39
`Chr7:1999941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,B97
`Chr7:1999957`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771735.1

635 aa

318

635

Cu_amine_oxidN2

Cu_amine_oxidN3

Cu_amine_oxid

PF02727 Cu_amine_oxidN2 21-108 aa PF02728 Cu_amine_oxidN3 121-222 aa PF01179 Cu_amine_oxid 240-633 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771735.1`	Pfam	`PF02727`	Cu_amine_oxidN2	Domain	21	108	8.8e-21	74.7	Copper amine oxidase, N2 domain
`XP_057771735.1`	Pfam	`PF02728`	Cu_amine_oxidN3	Domain	121	222	4.8e-22	78.8	Copper amine oxidase, N3 domain
`XP_057771735.1`	Pfam	`PF01179`	Cu_amine_oxid	Domain	240	633	9e-123	410.7	Copper amine oxidase, enzyme domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915752.1
TATATGTAGTATAGATCAATCAATGAAAGTTAAAAGAAATTAATAAAGAATATATATTCCCATTCTTGAAAACCATAAATGATAATAACAGTGATTGAATCTTGAACCAGACAAATTCACATCTAATTCTTGATGCCATGATAGTACCTCTCTCACTTCTTTCTACATTTTTTCTCATCATATCTCCATCTCTTTGCCACCCTTTAGATCCTCTCACTCCTCAAGAAATCCACACAGTTAAGCTCAGCATCCAAAATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991498
ATGATAGTACCTCTCTCACTTCTTTCTACATTTTTTCTCATCATATCTCCATCTCTTTGCCACCCTTTAGATCCTCTCACTCCTCAAGAAATCCACACAGTTAAGCTCAGCATCCAAAATTCCCTCTCTGCCTCATCTCCCAACATAAGCTTCCACTATGTTGAAGTGGATGAGCCAGAGAAGCATCATGTCCTAAAATGGCTGTCTTCGTGCAACCACAACGTGCCGTTCCCCACTCGTAGAGCCCGGGCAGTGGTTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771735.1
MIVPLSLLSTFFLIISPSLCHPLDPLTPQEIHTVKLSIQNSLSASSPNISFHYVEVDEPEKHHVLKWLSSCNHNVPFPTRRARAVVRVSGETRELVVDLAGGSVVSDQVYRGHGYPPFTFDEFLKASRLSLRHPSFQDSILRRGLELSEVTCLPLTVGWFGEAARRRVVRVTCFYRNGTSNIWARPIQGISLLVDVEENRVLSYWDRPRAPLPKAQGTNFQRQGPSSVSCSGNSSKITIIGNIVKWANWEFHVAFDARAG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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