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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000307`

染色体: Chr07 坐标: 2019820-2020781 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000307`
名称	SmilChr07G000307
描述	photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2019820 - 2020781 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991501`
GeneID	`130991501`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991501`
原始查询	`SmilChr07G000307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic-like
产物	photosystem I reaction center subunit II%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G03130` (PSAD-2) photosystem I subunit D-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838400] identity=74.5; qcov=1.01; evalue=5.75e-103; confidence=high
Rice	`Os08g0560900` (PsaD) - identity=74.6; qcov=1; evalue=2.73e-103; confidence=high
GO	GO:0009522 (photosystem I); GO:0009538 (photosystem I reaction center); GO:0015979 (photosynthesis)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02531 (PsaD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991501

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771738.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057771738.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057771738.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057771738.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2019964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,D7
`Chr7:2019991`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr7:2019991`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr7:2020047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr7:2020239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr7:2020363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr7:2020371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:2020374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr7:2020391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B132,B134,C1,C77
`Chr7:2020393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C33,C46
`Chr7:2020395`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A18,A19,B137,B140,B18,B25,B31,B33,B48,B51,B6,B64,B88,B90,C42,C48,C67,C71,C8,D10,D6,D7,D8
`Chr7:2020443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771738.1

205 aa

102

205

PsaD

PF02531 PsaD 72-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771738.1`	Pfam	`PF02531`	PsaD	Family	72	203	2.5e-68	228.6	PsaD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915755.1
AAAAAAATAAAAATAGGAAATCCAAATAAATACAGATGGCACCACAAAGCAAGGGGTAAGGGTAAGGCTTGGTATCAAAATCACACAATCTAATTGGTCTCACCCATATCACCTTATCCCAATATCCAAATCTCCCAAACATTATTTCTCATCAAATATTATTCCACCCTCCAATTCCAATTCCATTTCCACCACCCAAAAGAGAATCCATGGCAATGGCAACGCAAGCCTCCCTCTTCTCCGCCGCCGCCGTCCCGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991501
ATGGCAATGGCAACGCAAGCCTCCCTCTTCTCCGCCGCCGCCGTCCCGAAATCCGCCGTGGCGGCCCCGTGGAAGCAGTCCCTCGCCCACTTCCCATCCCTCAAGCCCTCCAAAACCCTAGCTCGGGGCCCCATCCGCGCGATGGCGGAGGAGGCCCCGACCAAGGAGGCGCCCGCGGCCCCGGCGGGGTTCACCCCGCCGGAGCTGGACCCGAACACGCCGTCCCCGATCTTCGGGGGCAGCACGGGCGGGCTCCTGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771738.1
MAMATQASLFSAAAVPKSAVAAPWKQSLAHFPSLKPSKTLARGPIRAMAEEAPTKEAPAAPAGFTPPELDPNTPSPIFGGSTGGLLRKAQVEEFYVITWDSPKEQVFEMPTGGAAIMRQGPNLLKLARKEQCLALGTRLRSKYKIKYQFYRVFPNGEVQYLHPKDGVYPEKVNAGRTGVGLNLRSIGKNASPIEVKFTGKQVYDL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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