当前解析结果
SmilChr07G000320| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000320 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000320 |
| 描述 | sugar transport protein 8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 2155393 - 2156080 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130991516 |
|---|---|
| GeneID | 130991516 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991516 |
| 原始查询 | SmilChr07G000320 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | sugar transport protein 8-like |
| 产物 | sugar transport protein 8-like |
| Arabidopsis | AT5G26250 (AT5G26250)Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832694] identity=66.7; qcov=0.938; evalue=2.41e-45; confidence=medium |
| Rice | Os03g0218400 (OsMST4)- identity=59.3; qcov=0.964; evalue=1.13e-43; confidence=medium |
| GO | GO:0015144 (carbohydrate transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00083 (Sugar_tr) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991516 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057771760.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057771760.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771760.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771760.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771760.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:2155665 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr7:2155720 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr7:2155734 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C11 |
Chr7:2155983 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A9,C49 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771760.1PF00083
Sugar_tr 2-89 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771760.1 |
Pfam | PF00083 |
Sugar_tr | Family | 2 | 89 | 5.2e-22 | 79.1 | Sugar (and other) transporter |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。