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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000323`

染色体: Chr07 坐标: 2169655-2173576 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000323`
名称	SmilChr07G000323
描述	RAN GTPase-activating protein 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2169655 - 2173576 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991519`
GeneID	`130991519`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991519`
原始查询	`SmilChr07G000323`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RAN GTPase-activating protein 2
产物	RAN GTPase-activating protein 2
Arabidopsis	`AT3G63130` (RANGAP1) RAN GTPase activating protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825488] identity=64.2; qcov=0.937; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0543200` - identity=65.1; qcov=0.924; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13516 (LRR_6); PF13943 (WPP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991519

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057771763.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057771763.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771763.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771763.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057771763.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2171773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C26
`Chr7:2171879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B93
`Chr7:2171980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr7:2172357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr7:2172776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771763.1

542 aa

271

542

WPP

LRR_6

PF13943 WPP 17-111 aa PF13516 LRR_6 216-236 aa PF13516 LRR_6 385-406 aa PF13516 LRR_6 413-433 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771763.1`	Pfam	`PF13943`	WPP	Domain	17	111	2.4e-35	121.8	WPP domain
`XP_057771763.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	216	236	2.3e-17	62.3	Leucine Rich repeat
`XP_057771763.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	385	406	2.3e-17	62.3	Leucine Rich repeat
`XP_057771763.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	413	433	2.3e-17	62.3	Leucine Rich repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915780.1
AAATTCATTTTATTGTTCATCTATCTTATTGGGGAAAAAAGATAAGAAAATGGAAAAAGAAAGAAGAATAAAAAAAAGTGATGAGAAAAATAAAAATAAAAAGAGCGGAAGAAGAAGCAAAATCCAAAACTCAAAAATTCCCAAATTGAAAAACCCTCCTTCCCTCATTCGCGAATCGCGCCACCGTCGCTGTTCTTACGCCACCGCCGAACATTGATTTCACTTCGCTTTCTCTCACTTCCCCTCTCTCTGTGTGTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991519
ATGGAGAACGCCGCCAAAACACCAAATGGAGAACGCCGCCAAATCACTATTAAGCTCTGGCCTCCTAGTGAAAACACTCGGCTGATGTTAGTTGAGCGAATGACGAATAATCTCTCCACGCCAACAATTTTCACCAGGAAGTACGGCAGTCTCGGTCAAGCAGAGGCTGCAAAATATGCTAAACAAATTGAGGAATCCGCATTTTCTTCAGCAAATCAGCACTATGAACAAGAGCCCGATGGTGATGGAAGTTCTGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771763.1
MENAAKTPNGERRQITIKLWPPSENTRLMLVERMTNNLSTPTIFTRKYGSLGQAEAAKYAKQIEESAFSSANQHYEQEPDGDGSSAVQLYARECSKLILEVLKGGAKLEEKEALKSEVESAPRETFFDISKGQRAFIEADEAQVLLNPLKEAGNSYTKICFSNRSFGLGAAHVAGPILASIKNQLKEVDLSDFVAGRPEAEALDVMNIFSEALEGSHLKYLNISDNALGEKGVRAFEKLLRSQTSLEELYLMNDGISKEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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