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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000330`

染色体: Chr07 坐标: 2244615-2248868 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000330`
名称	SmilChr07G000330
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 58, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2244615 - 2248868 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991527`
GeneID	`130991527`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991527`
原始查询	`SmilChr07G000330`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 58, chloroplastic
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 58%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G19210` (AT5G19210) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832041] identity=69.2; qcov=1; evalue=4.48e-170; confidence=high
Rice	`Os01g0970600` (OsRH58) - identity=66.5; qcov=0.994; evalue=1.28e-159; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C); PF04851 (ResIII)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991527

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771777.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057771778.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057771777.1`
4	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057771778.1`
5	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057771777.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2244911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C65
`Chr7:2246008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:2247159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C82
`Chr7:2248330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B13
`Chr7:2248379`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771777.1

471 aa

236

471

DEAD

ResIII

Helicase_C

PF00270 DEAD 96-269 aa PF04851 ResIII 109-232 aa PF00271 Helicase_C 313-433 aa

XP_057771778.1

318 aa

159

318

DEAD

Helicase_C

PF00270 DEAD 24-116 aa PF00271 Helicase_C 160-280 aa

XP_057771779.1

318 aa

159

318

DEAD

Helicase_C

PF00270 DEAD 24-116 aa PF00271 Helicase_C 160-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771777.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	96	269	1.6e-31	110.0	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057771777.1`	Pfam	`PF04851`	ResIII	Family	109	232	9.5e-08	32.8	Type III restriction enzyme, res subunit
`XP_057771777.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	313	433	6.9e-17	62.4	Helicase conserved C-terminal domain
`XP_057771778.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	24	116	3.6e-09	37.3	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057771778.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	160	280	4.5e-17	63.0	Helicase conserved C-terminal domain
`XP_057771779.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	24	116	3.6e-09	37.3	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057771779.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	160	280	4.5e-17	63.0	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915794.1
TGTTTCTCTTCTCCTTCTTCACTGAAGAAATCATGTCCATGGCGTCTTCCTCTGCGACGCATACGCACCTCTTACCATGGACCTCCTCGATGAAGCTGCTCTCTCATTCCTTCGCCCGCCCTAATTGCACGAGCTCATTGCTTTCTTACCGCAGAAACCGTATGTCAAACTGCCATTCGCTCTCTGCTTCTGTCAGCTCCACTGCTCAATCCGATGTGGAAACCAGCAATACTTGTTCGACGCTGCGTGAACTGTGCGAA...

XM_057915795.1
AGGGCGGAGGAGGTTGGATACATGGTGCCGACGCCGGTACAGAGTGAGGCGCTGCCGGTGTTATTTTCCGGCCGTGATTGTGTGATTCATGCTCAGGCTCAGGAAAGACCCTAGCATACCTACTTTTGATATTCTCAGTTGTCAATGCACAAAGGTCATCTGTACAGGCTGTGATCGTTGTACCCACACGAGAACTCGGCATGCAGGTCACAAAAGTCGCGCGTACTTTGGCTGCAAAAGCTCTGCAACTTGAGAATGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130991527
ATGTCCATGGCGTCTTCCTCTGCGACGCATACGCACCTCTTACCATGGACCTCCTCGATGAAGCTGCTCTCTCATTCCTTCGCCCGCCCTAATTGCACGAGCTCATTGCTTTCTTACCGCAGAAACCGTATGTCAAACTGCCATTCGCTCTCTGCTTCTGTCAGCTCCACTGCTCAATCCGATGTGGAAACCAGCAATACTTGTTCGACGCTGCGTGAACTGTGCGAAGGTCACGTGCCCGATCACGTGCTCCGGAGGGC...

LOC130991527
ATGCAGGTCACAAAAGTCGCGCGTACTTTGGCTGCAAAAGCTCTGCAACTTGAGAATGAACAGAAGCCATGTACAGTCATGGCTCTTTTAGATGGTGGAACATTGAGAAGACATAAGAGTTGGTTAAAGGTGGAACCCCCAGCTATAGTAATTGCTACTTTGAGGAGTCTATGCCAGATGCTTGACAAGCATACTCTTAAGTTGGATGCCTTGCGAGTGTTGGTAATTGATGAGGTTGATTTCATGTTCAATTCTTCCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057771777.1
MSMASSSATHTHLLPWTSSMKLLSHSFARPNCTSSLLSYRRNRMSNCHSLSASVSSTAQSDVETSNTCSTLRELCEGHVPDHVLRRAEEVGYMVPTPVQSEALPVLFSGRDCVIHAQTGSGKTLAYLLLIFSVVNAQRSSVQAVIVVPTRELGMQVTKVARTLAAKALQLENEQKPCTVMALLDGGTLRRHKSWLKVEPPAIVIATLRSLCQMLDKHTLKLDALRVLVIDEVDFMFNSSKEVSSLKKLLTIYSSINSRQT...

XP_057771778.1
MQVTKVARTLAAKALQLENEQKPCTVMALLDGGTLRRHKSWLKVEPPAIVIATLRSLCQMLDKHTLKLDALRVLVIDEVDFMFNSSKEVSSLKKLLTIYSSINSRQTVFASASIPQHRRFVYDCIQQKWTKADVVHVHVNPIEPMPSCLHHRYVICGNREKYTTLLHLLQSDAPQSAIIFLGEQSEKSKKAGNAPPTTLLIEFLKSSYGGCLELVLLEEDINFNQRATSITDLKQSGGYLLVATDIAGRGVDLPETTHIY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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