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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000339`

染色体: Chr07 坐标: 2290701-2293574 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000339`
名称	SmilChr07G000339
描述	stem-specific protein TSJT1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2290701 - 2293574 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991538`
GeneID	`130991538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991538`
原始查询	`SmilChr07G000339`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stem-specific protein TSJT1
产物	stem-specific protein TSJT1
Arabidopsis	`AT5G19140` (AILP1) aluminum induced protein with YGL and LRDR motifs [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832034] identity=78.1; qcov=0.987; evalue=2.24e-137; confidence=high
Rice	`Os12g0145100` - identity=67.8; qcov=1; evalue=1.52e-116; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12481 (DUF3700); PF13522 (GATase_6); PF13537 (GATase_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057771796.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057771796.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771796.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771796.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771796.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2291277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C76
`Chr7:2291557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:2291713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771796.1

236 aa

118

236

DUF3700

GATase_7

GATase_6

PF12481 DUF3700 2-226 aa PF13537 GATase_7 75-172 aa PF13522 GATase_6 122-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771796.1`	Pfam	`PF12481`	DUF3700	Domain	2	226	1.2e-92	310.2	Aluminium induced protein
`XP_057771796.1`	Pfam	`PF13537`	GATase_7	Domain	75	172	2.6e-09	37.9	Glutamine amidotransferase domain
`XP_057771796.1`	Pfam	`PF13522`	GATase_6	Domain	122	179	3.6e-08	33.8	Glutamine amidotransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915813.1
TAATCGGGGGAGGTAAGCTGCAAGTTACAACCTTCTCCCAATTATTCAAAATAAAATAAAAATGGATTCAAGTCGTGAATTTACGAAAACACCCTCACCTTTCTTTCTATAAATCCAAATCGCCCCTCTCTGTATTTCCTTCCATTCCATTTCCATACCCTTCAGCCACTGTAATAGAAGCATATTATTCTGTGTGTATCTCCATTTCTAGAGAGAGGAGAGAGAAAATGTTGGGAGTATTCAGCAGCTCGATCATGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991538
ATGTTGGGAGTATTCAGCAGCTCGATCATGTCGCCGCCGGAAGAGCTGGTGGCAGCGGGGAGCCGGACGCCGTCGCCTAAAGTGACGGCGGACAAGCTGGTGGCGCGATTCCTCGACGCCAATGCTTCCGCGGTCTCCGTTAAGGTCGGCGATGATGTCCAGCTGGCCTACTCTCACAGCAATCAGTCTGCTTTGCTGCCGAGATCGTTTGCAGTGAAGGATGAAATATTCTGCTTGTTTGAAGGCGTACTCGACAACTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771796.1
MLGVFSSSIMSPPEELVAAGSRTPSPKVTADKLVARFLDANASAVSVKVGDDVQLAYSHSNQSALLPRSFAVKDEIFCLFEGVLDNLGSLKQQYGLAKSANEVLLMIEAYKTLRDRAPYPPNHVVGHLEGNFAFIVFDKSTSTLFVATDPNAKVPLYWGITADGYVAFADDANLLKGACGKSLASFPQGCFFSTAVGEIRSYENPKNKITAIPAQEEEIWGAKFMVEGPSIVAATK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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