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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000346`

染色体: Chr07 坐标: 2341671-2343162 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000346`
名称	SmilChr07G000346
描述	probable aspartic proteinase GIP2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2341671 - 2343162 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991546`
GeneID	`130991546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991546`
原始查询	`SmilChr07G000346`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aspartic proteinase GIP2
产物	probable aspartic proteinase GIP2
Arabidopsis	`AT1G03220` (AT1G03220) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838517] identity=40.5; qcov=0.988; evalue=5.55e-92; confidence=medium
Rice	`Os05g0402900` (OsBphi262) - identity=40.5; qcov=1; evalue=1.03e-84; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057771806.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057771806.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771806.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771806.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2341984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B70,B87,C4
`Chr7:2342008`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C29
`Chr7:2342027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr7:2342109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B131,B5
`Chr7:2342241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:2342245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr7:2342255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,D6
`Chr7:2342303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:2342328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:2342415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,D6
`Chr7:2342515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B29,C1
`Chr7:2342529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771806.1

402 aa

201

402

TAXi_N

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 38-199 aa PF14541 TAXi_C 229-389 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771806.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	38	199	2.5e-29	103.4	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057771806.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	229	389	1.7e-53	181.5	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915823.1
GGATTAATCATATCTTAATTAATAAACTCCATGCAAGTAGTACTCATATTTATTAAAAGCAGCCATCTTTGAACACCACATTTAAATTTTAATAATTCCTGCATCTTCTTCCACACTACTTCTATATCACATTATTCAACCTCTATATATATATAACTAATAATCCATTACTCATTTCATCCAAGTTCCAACCATGGCTTCCTTCCTTTCCTCCACTCTCTTCCTCGCACTCATCATCTCCGCCGTCGCCGCCCAAAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991546
ATGGCTTCCTTCCTTTCCTCCACTCTCTTCCTCGCACTCATCATCTCCGCCGTCGCCGCCCAAAACGGCCTAATCCTCCCCATCCGCAAAGACCCCAAAACCTTACAACACATCGCCACATTCAAAATGGGCAGCAACCGCGCCGCCATCAGCGCCGCCGTCGACCTCGGCGGCCCCTTCCTCTGGTTCTCCTGCAACGACTACGCCTCCACAACCTACGCCCCCATCCCCTGCGGCTCCGCGAAATGCGACGCCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771806.1
MASFLSSTLFLALIISAVAAQNGLILPIRKDPKTLQHIATFKMGSNRAAISAAVDLGGPFLWFSCNDYASTTYAPIPCGSAKCDAAKGIGCVGCNLPPRPGCTNDTCGASPYNPFLDVLVSQGYAEDTFYAKSGAPLPEYSFSCMDKDYLTGLAAGATGMLGLGRTQISLHRQASAKLNLPDAFSLCLPSSGAGKLEIGIKPRSVKTTPLLINPVSTYPIYTEGDASDEYFIDVRGIAVAGARLNLKDSYFSIDKNGVGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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