当前解析结果
SmilChr07G000349| 统一新 Gene ID | SmilChr07G000349 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G000349 |
| 描述 | transcription factor MUTE |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 2364989 - 2366452 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130991550 |
|---|---|
| GeneID | 130991550 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130991550 |
| 原始查询 | SmilChr07G000349 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | transcription factor MUTE |
| 产物 | transcription factor MUTE |
| Arabidopsis | AT3G06120 (MUTE)basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819785] identity=67.7; qcov=1; evalue=4.21e-88; confidence=high |
| Rice | Os05g0597000 (OsbHLH055)- identity=55.8; qcov=1.11; evalue=1.99e-72; confidence=high |
| GO | GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0010052 (guard cell differentiation); GO:0010374 (stomatal complex development); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00010 (HLH) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130991550 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057771814.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057771814.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057771814.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057771814.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057771814.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:2365368 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr7:2365418 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,B59,C23 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057771814.1PF00010
HLH 2-50 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057771814.1 |
Pfam | PF00010 |
HLH | Domain | 2 | 50 | 1.3e-10 | 41.6 | Helix-loop-helix DNA-binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。