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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000358`

染色体: Chr07 坐标: 2459877-2461752 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000358`
名称	SmilChr07G000358
描述	organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2459877 - 2461752 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991559`
GeneID	`130991559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991559`
原始查询	`SmilChr07G000358`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organelle RRM domain-containing protein 6, chloroplastic-like
产物	organelle RRM domain-containing protein 6%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G19030` (AT5G19030) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832022] identity=47.8; qcov=0.539; evalue=2.46e-25; confidence=medium
Rice	`Os04g0414300` - identity=41.5; qcov=0.491; evalue=4.91e-15; confidence=low
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005686 (U2 snRNP); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057771828.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057771828.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057771828.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771828.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057771828.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2460091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B131,B55,B91,C6
`Chr7:2461172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr7:2461194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B100,B112,B126
`Chr7:2461213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:2461236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr7:2461332`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B80
`Chr7:2461349`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr7:2461361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B101
`Chr7:2461367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr7:2461393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B3,B31,B76,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771828.1

167 aa

167

RRM_1

PF00076 RRM_1 77-147 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771828.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	77	147	1.9e-17	63.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915845.1
TTAAAATTTTGGTTTTAATCATGAAAAATAAGCCCATTTGACTACCAGCCCAAAGTTCTAATACGTCGAAATTCGAATAGAGAAACTGTACGAATGTGTGAAAGTTGCAATTAGATAAAAAAAAATCTAGGGTTCCAAATGGCCCTCTTTTGCTCACCCTGTAAACCACCAATTCTGTGCCCTAAATTTCCAAGAAATTATTATGCGATTCAAAGGCCCTTGAAATCCAACACCCCAATTCTCGAAACCCCCTATTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991559
ATGGCCCTCTTTTGCTCACCCTGTAAACCACCAATTCTGTGCCCTAAATTTCCAAGAAATTATTATGCGATTCAAAGGCCCTTGAAATCCAACACCCCAATTCTCGAAACCCCCTATTTCAAAATCTCAATATCTGCTCCAACTAAAATTTTCAACAATAAAGCTAAATGTAGCTCAAATTTAAGCTCTTCCGCTGAATTGGAAGAAGATCCTCCCTCCAGTGTCGTAATCTTCGTAAAAGGGTTAGCCCTATCAACGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771828.1
MALFCSPCKPPILCPKFPRNYYAIQRPLKSNTPILETPYFKISISAPTKIFNNKAKCSSNLSSSAELEEDPPSSVVIFVKGLALSTGEGGLKAAFSRFGEVSRVKLVLDKKTKQPLGFAYVWFVREEHARTAIEDMNGQFFEGRFIHVALAKPGSCKTRPKPSAYKF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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