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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G000361`

染色体: Chr07 坐标: 2477114-2479745 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G000361`
名称	SmilChr07G000361
描述	uncharacterized protein At5g19025
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	2477114 - 2479745 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130991562`
GeneID	`130991562`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130991562`
原始查询	`SmilChr07G000361`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792]; symbol=AT3G06180; hit=AT3G06180; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792]; symbol=AT3G06180; hit=AT3G06180; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G06180` (AT3G06180) Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819792] identity=59.8; qcov=0.864; evalue=1.79e-67; confidence=high
Rice	`Os05g0393200` - identity=50; qcov=0.881; evalue=1.56e-38; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28125 (At5g19025_N); PF30682 (At5g19025_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130991562

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057771830.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057771830.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057771830.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057771830.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057771830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:2477510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr7:2477515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr7:2477519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr7:2477534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B20,C37
`Chr7:2477547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B65,C31
`Chr7:2477552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr7:2477578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B106,C59,C81
`Chr7:2477579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C14
`Chr7:2477581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B98,C60
`Chr7:2477593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C51
`Chr7:2477620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B50,C33,C45
`Chr7:2477696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,C26,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057771830.1

236 aa

118

236

At5g19025_N

At5g19025_C

PF28125 At5g19025_N 47-127 aa PF30682 At5g19025_C 142-214 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057771830.1`	Pfam	`PF28125`	At5g19025_N	Domain	47	127	6.8e-18	66.0	At5g19025 N-terminal domain
`XP_057771830.1`	Pfam	`PF30682`	At5g19025_C	Domain	142	214	1.3e-39	134.5	At5g19025 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057915847.1
GTTTGAAGACATAAAAAGCATTAAAATCTGCAAGAATATTCAGTTTGAGAAGAAGGGAAGTGCAAGCAACAAAATTAAATAGCCAATTATTAATTCCTGCGCAGCTTCTTGAACTACTCCAGTAACGTACGCACTCCCGGCCCGGGCGCTAACATGCGCACCGCCCCCTCTCGCCCCACCTTTTCCACCTGAAAAATACCTTCCGCCGCCCCCCTTTTTATCACTAACATGCGCCATCTCCACCACTCCATCACCGCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130991562
ATGCGCCATCTCCACCACTCCATCACCGCCATGGCCCCTTCCTCCTCCCTCAGAAAAACCCCAATTCCAAAAACCCCCGCCCCCAACCACCCGAATTCCCCGAACTGCCCCTCCCTCTGCCGCCACTCGCCCTCCGCCACTCTGGACCTCCTCATCTTCATCCTCGTCCTCTTCTCCGGCGCCTTCCTCATCGTCTCCTGCTTCTCGTATCTCTTCCAGTCGCTCTCTCTCATCCTGCCCCCCTTCTCCACCGTGGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057771830.1
MRHLHHSITAMAPSSSLRKTPIPKTPAPNHPNSPNCPSLCRHSPSATLDLLIFILVLFSGAFLIVSCFSYLFQSLSLILPPFSTVAAHFHRHFASNPQSQLIFFTLFAVSFVGFVIFFEICCGHRSRRCERKGCRGLKKAMEFDLQLQGEELLRSGDANKAVRDVNELPWKGGGEDNPDYECLRAELRKMAPPNGRAVLLFRDKCGCPVAKLEGWGPKRGRRHKKSLSLTAGGDQR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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